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アイテム
RNA-seq解析における多群間比較に対応した正規化法
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/91302
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/91302ebecdb88-7907-4844-bd05-2692c14999d0
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
|---|---|---|
IPSJ-BIO13033009.pdf (2.1 MB)
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Copyright (c) 2013 by the Information Processing Society of Japan
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| オープンアクセス | ||
| Item type | SIG Technical Reports(1) | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 公開日 | 2013-03-14 | |||||||
| タイトル | ||||||||
| タイトル | RNA-seq解析における多群間比較に対応した正規化法 | |||||||
| 言語 | ||||||||
| 言語 | jpn | |||||||
| キーワード | ||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||
| 主題 | RNA | |||||||
| 資源タイプ | ||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh | |||||||
| 資源タイプ | technical report | |||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 京都大学iPS細胞研究所 | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 京都大学iPS細胞研究所 | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Center for iPS Cell Research and Application, Kyoto University | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Center for iPS Cell Research and Application, Kyoto University | ||||||||
| 著者名 |
田中道廣
藤渕航
× 田中道廣 藤渕航
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| 論文抄録 | ||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||
| 内容記述 | RNA-Seq 解析は細胞中に存在する RNA 配列を直接定量するために，高精度な発現プロファイルを取得できることが期待されている．一般的に，RNA の総量はサンプル間で異なるため，複数のサンプルに由来する発現プロファイルを比較する場合には，サンプル間での発現値の正規化が不可欠である．これまで，二群間比較における Trimmed mean of M values (TMM) 正規化法 （Robinson et al.，2010） は提案されていたが，多群間比較に拡張することは難しかった．今回我々は，TMM 法を多群間比較に拡張可能な手法を開発した． | |||||||
| 書誌レコードID | ||||||||
| 収録物識別子タイプ | NCID | |||||||
| 収録物識別子 | AA12055912 | |||||||
| 書誌情報 |
研究報告バイオ情報学（BIO） 巻 2013-BIO-33, 号 9, p. 1-3, 発行日 2013-03-14 |
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| Notice | ||||||||
| SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc. | ||||||||
| 出版者 | ||||||||
| 言語 | ja | |||||||
| 出版者 | 情報処理学会 | |||||||
