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アイテム
ドッキングシミュレーションにおける試行錯誤的なパラメータ調整支援システム
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/58993
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/58993b4d8c2cc-4943-4bfe-afb0-450a7f35e688
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
|---|---|---|
IPSJ-BIO07008009.pdf (757.2 kB)
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Copyright (c) 2007 by the Information Processing Society of Japan
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| オープンアクセス | ||
| Item type | SIG Technical Reports(1) | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 公開日 | 2007-03-05 | |||||||
| タイトル | ||||||||
| タイトル | ドッキングシミュレーションにおける試行錯誤的なパラメータ調整支援システム | |||||||
| タイトル | ||||||||
| 言語 | en | |||||||
| タイトル | A System Assisting Trial-and-Error Parameter Tuning for Docking Simulation | |||||||
| 言語 | ||||||||
| 言語 | jpn | |||||||
| 資源タイプ | ||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh | |||||||
| 資源タイプ | technical report | |||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 大阪大学大学院情報科学研究科 | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 大阪大学大学院情報科学研究科 | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 大阪大学大学院情報科学研究科／三井情報開発株式会社 | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 大阪大学サイバーメディアセンター | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Graduate School of Information Science and Technology, Osaka University | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Graduate School of Information Science and Technology, Osaka University | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Graduate School of Information Science and Technology / Osaka University,Mitsui Knowledge Industry Co., Ltd | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Cybermedia Center, Osaka University | ||||||||
| 著者名 |
前野, 隆史
伊達, 進
水戸, 善之
下條, 真司
× 前野, 隆史 伊達, 進 水戸, 善之 下條, 真司
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| 著者名(英) |
TAKASHI, MAENO
SUSUMU, DATE
YOSHIYUKI, KlDO
Shinji, Shimojo
× TAKASHI, MAENO SUSUMU, DATE YOSHIYUKI, KlDO Shinji, Shimojo
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| 論文抄録 | ||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||
| 内容記述 | 今日，計算機を利用した薬物候補化合物のスクリーニングに関する期待と関心が高まっている．スクリーニングで利用されるドッキングシミュレーションでは，パラメータ数の多さや関連するツール間の依存によって，パラメータ調整が複雑になっている現状がある．そのため研究者は，複数のツールを用いたパラメータ調整を試行錯誤的に行わなければならない現状がある．本稿では，ツール・パラメータの選定・設定を柔軟な階層構造で表現できる「試行セット」と呼ばれるモデルを表現したデータ構造を用いて，ツール実行を効率よく実施するための支援システムを提案する．本システムによりドッキングシミュレーションを利用したスクリーニング全体の効率性の向上が見込まれる． | |||||||
| 論文抄録(英) | ||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||
| 内容記述 | Molecular docking simulation is a promising application for drug design. Although docking simulation and the related information technology have advanced in recent years, scientists still have difficulty in finding a suitable parameter set of docking programs because parameter-tuning step contains the scientists' trial-and-error processes. We define "trial set" model that can flexibly describe tools' flow and a way of parameter tuning for that tools. In this paper, we propose a system that can perform procedures described in a trial set to assist scientists' trial-and-error in parameter tuning. This system has potential to improve the whole process of in-silico screening. | |||||||
| 書誌レコードID | ||||||||
| 収録物識別子タイプ | NCID | |||||||
| 収録物識別子 | AA12055912 | |||||||
| 書誌情報 |
情報処理学会研究報告バイオ情報学（BIO） 巻 2007, 号 21(2007-BIO-008), p. 63-70, 発行日 2007-03-05 |
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| Notice | ||||||||
| SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc. | ||||||||
| 出版者 | ||||||||
| 言語 | ja | |||||||
| 出版者 | 情報処理学会 | |||||||
