| Item type |
SIG Technical Reports(1) |
| 公開日 |
2022-03-03 |
| タイトル |
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タイトル |
埋め込みベクトルによるCpGアイランドのメチル化状態予測 |
| 言語 |
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言語 |
jpn |
| 資源タイプ |
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資源タイプ識別子 |
http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh |
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資源タイプ |
technical report |
| 著者所属 |
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九州大学芸術工学部 |
| 著者所属 |
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九州大学生体防御医学研究所分子機能制御学部門エピゲノム制御学分野 |
| 著者所属 |
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九州大学生体防御医学研究所分子機能制御学部門エピゲノム制御学分野 |
| 著者所属 |
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九州大学大学院芸術工学研究院 |
| 著者所属(英) |
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en |
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School of Design, Kyushu Uniersity |
| 著者所属(英) |
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en |
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Division of Epigenomics and Development, Department of Molecular and Structural Biology Medical Institute of Bioregulation, Kyushu Uniersity |
| 著者所属(英) |
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en |
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Division of Epigenomics and Development, Department of Molecular and Structural Biology Medical Institute of Bioregulation, Kyushu Uniersity |
| 著者所属(英) |
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en |
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Faculty of Design, Kyushu Uniersity |
| 著者名 |
成田, 浩規
Au, Yeung Wan Kin
佐々木, 裕之
丸山, 修
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| 論文抄録 |
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内容記述タイプ |
Other |
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内容記述 |
本研究では，CpGアイランド(CpG island, CGI)のメチル化状態を予測する手法CGI2methを提案する．CGI2methは，文章のベクトル化手法であるdoc2vecにより各CGI配列を埋め込みベクトルvに変換し，k近傍法などの分類器によりvからCGIのメチル化状態を予測する．本手法を2種類の細胞タイプ（ヒト・リンパ球とマウスの単為生殖の胚盤胞）のWGBSデータに適用し，それぞれのF値が0.793と0.964という良好な結果が得られたことを報告する． |
| 書誌レコードID |
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収録物識別子タイプ |
NCID |
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収録物識別子 |
AA12055912 |
| 書誌情報 |
研究報告バイオ情報学（BIO）
巻 2022-BIO-69,
号 13,
p. 1-2,
発行日 2022-03-03
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| ISSN |
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収録物識別子タイプ |
ISSN |
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収録物識別子 |
2188-8590 |
| Notice |
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SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc. |
| 出版者 |
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言語 |
ja |
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出版者 |
情報処理学会 |
IPSJ-BIO22069013.pdf (7.2 MB)
