構造情報に基づくタンパク質間相互作用ネットワーク予測精度の改善

• Item type: SIG Technical Reports(1)
• 公開日: 2012-11-29
• タイトル: 構造情報に基づくタンパク質間相互作用ネットワーク予測精度の改善
• タイトル / 言語: en
• タイトル: Improvement of the Accuracy for Protein-Protein Interaction Network Prediction Based on Tertiary Structural Information
• 言語: jpn
• 資源タイプ / 資源タイプ識別子: http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh
• 資源タイプ: technical report
• 著者所属: 東京工業大学大学院情報理工学研究科計算工学専攻
• 著者所属: 東京工業大学大学院情報理工学研究科計算工学専攻／日本学術振興会特別研究員
• 著者所属: 東京工業大学大学院情報理工学研究科計算工学専攻
• 著者所属: 東京工業大学大学院情報理工学研究科計算工学専攻
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Graduate School of Information Science and Engineering, Tokyo Institute of Technology
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Graduate School of Information Science and Engineering, Tokyo Institute of Technology / Research Fellow of the Japan Society for the Promotion of Science
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Graduate School of Information Science and Engineering, Tokyo Institute of Technology
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Graduate School of Information Science and Engineering, Tokyo Institute of Technology
• 著者名: 山本, 航平; 大上, 雅史; 石田, 貴士; 秋山, 泰
• 著者名(英): Kohei, Yamamoto; Masahito, Ohue; Takashi, Ishida; Yutaka, Akiyama
• 論文抄録 / 内容記述タイプ: Other
• 論文抄録 / 内容記述: 我々はタンパク質間相互作用ネットワークを予測することを目的としてタンパク質間ドッキング計算に基づいたタンパク質間相互作用予測手法を開発している．従来相互作用予測を行う際は，予測対象のタンパク質ペアの情報のみを用いて相互作用評価値の計算を行っていたが，本研究ではよりネットワーク予測に適した手法として，対象ペアが，他の相互作用候補ペアと比べてどの程度相互作用し得るかを相対的に評価することで予測精度を向上させることに成功した．
• 論文抄録(英) / 内容記述タイプ: Other
• 論文抄録(英) / 内容記述: We have developed a method to predict protein-protein interaction based on docking calculation for getting information of protein-protein interaction networks. In this study, we propose a new method to predict a protein-protein interaction network. Our proposed method uses not only the docking results of a pair but also the results of the other protein pairs including a protein of the target pair. With the new method, we succeeded to improve the accuracy of the prediction of protein-protein interaction networks.
• 書誌レコードID / 収録物識別子タイプ: NCID
• 書誌レコードID / 収録物識別子: AA12055912
• 書誌情報: 研究報告バイオ情報学（BIO）; 巻 2012-BIO-32, 号 14, p. 1-7, 発行日 2012-11-29
• Notice: SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc.
• 出版者 / 言語: ja
• 出版者: 情報処理学会