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アイテム
ペトリネットによる転写制御ネットワークのモデリングと統計的推測
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/58880
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/5888024b98143-d772-40a4-9235-875c5632d561
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
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IPSJ-BIO08013003.pdf (961.6 kB)
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Copyright (c) 2008 by the Information Processing Society of Japan
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| オープンアクセス | ||
| Item type | SIG Technical Reports(1) | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 公開日 | 2008-06-19 | |||||||
| タイトル | ||||||||
| タイトル | ペトリネットによる転写制御ネットワークのモデリングと統計的推測 | |||||||
| タイトル | ||||||||
| 言語 | en | |||||||
| タイトル | Graphical modeling and statistical inferences of transcription regulatory networks using hybrid functional Petri net | |||||||
| 言語 | ||||||||
| 言語 | jpn | |||||||
| 資源タイプ | ||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh | |||||||
| 資源タイプ | technical report | |||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 情報・システム研究機構統計数理研究所 | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センター | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センター | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センター | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センター | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 情報・システム研究機構統計数理研究所 | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Institute of Statistical Mathematics, Research Organization of Information and Systems | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Human Genome Center, Institute of Medical Science, University of Tokyo | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Human Genome Center, Institute of Medical Science, University of Tokyo | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Human Genome Center, Institute of Medical Science, University of Tokyo | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Human Genome Center, Institute of Medical Science, University of Tokyo | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Institute of Statistical Mathematics, Research Organization of Information and Systems | ||||||||
| 著者名 |
吉田, 亮
長崎, 正郎
山口, 類
井元, 清哉
宮野, 悟
樋口, 知之
× 吉田, 亮 長崎, 正郎 山口, 類 井元, 清哉 宮野, 悟 樋口, 知之
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| 著者名(英) |
Ryo, Yoshida
Masao, Nagasaki
Rui, Yamaguchi
Seiya, Imoto
Satoru, Miyano
Tomoyuki, Higuchi
× Ryo, Yoshida Masao, Nagasaki Rui, Yamaguchi Seiya, Imoto Satoru, Miyano Tomoyuki, Higuchi
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| 論文抄録 | ||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||
| 内容記述 | 遺伝子発現情報を利用して生体内分子ネットワークを推測するための統計解析理論について議論する．生体内分子ネットワークとは，細胞内で起こる様々な化学反応の連鎖を表す多義的な用語である．具体例としては，転写制御(mRNA の合成)，タンパク質相互作用ネットワーク，代謝ネットワークなどが挙げられる．ネットワークの統計的推測の過程は次のように要約される: (1) 生体内分子ネットワークの(インシリコ) モデリング (2) 観測データ（例えば遺伝子発現データ）にもとづくモデルパラメータの推定 (4) 推定モデルの性能評価 (5) リモデリング．本研究の目標は，これら一連の過程に関わる方法論を整備することである．ここでは，時系列遺伝子発現データを利用した転写制御ネットワークの推測を例に，提案手法について概説する． | |||||||
| 論文抄録(英) | ||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||
| 内容記述 | Building in silico simulation models of genetic regulatory networks provides a rigorous tool for unraveling complex machinery of biological pathways. To proceed to in silico simulations, it is an essential first step to find the effective values of kinetic rate constants, which are difficult to measure directly from in vivo and in vitro experiments. The aim of this research is to present a new statistical technology, called Genomic Data Assimilation, for the data-driven construction of in silico simulation models. | |||||||
| 書誌レコードID | ||||||||
| 収録物識別子タイプ | NCID | |||||||
| 収録物識別子 | AA12055912 | |||||||
| 書誌情報 |
情報処理学会研究報告バイオ情報学（BIO） 巻 2008, 号 58(2008-BIO-013), p. 9-11, 発行日 2008-06-19 |
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| Notice | ||||||||
| SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc. | ||||||||
| 出版者 | ||||||||
| 言語 | ja | |||||||
| 出版者 | 情報処理学会 | |||||||
