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アイテム
タンパク質配列のグラフ表示に適したアミノ酸指標の組み合わせの探索
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/236988
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/23698895500084-6e2f-42cf-8855-8519482d5ca5
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
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IPSJ-Z86-4ZK-02.pdf (811.2 kB)
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Copyright (c) 2024 by the Information Processing Society of Japan
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| Item type | National Convention(1) | |||||||||
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| 公開日 | 2024-03-01 | |||||||||
| タイトル | ||||||||||
| タイトル | タンパク質配列のグラフ表示に適したアミノ酸指標の組み合わせの探索 | |||||||||
| 言語 | ||||||||||
| 言語 | jpn | |||||||||
| キーワード | ||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||
| 主題 | コンピュータと人間社会 | |||||||||
| 資源タイプ | ||||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_5794 | |||||||||
| 資源タイプ | conference paper | |||||||||
| 著者所属 | ||||||||||
| 弘前大 | ||||||||||
| 著者所属 | ||||||||||
| 弘前大 | ||||||||||
| 著者名 |
土山, 啓汰
× 土山, 啓汰
× 水田, 智史
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| 論文抄録 | ||||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||||
| 内容記述 | 本研究ではグラフ表示を用いたタンパク質のアミノ酸配列の比較における、最適なアミノ酸指標の組み合わせを探索する。アミノ酸配列のグラフ表示は、各アミノ酸にアミノ酸指標データベースである AAindex 中の指標値を成分とするベクトルを割り当て、配列毎に多次元座標群を生成することにより行う。その後、得られた座標群に対して主成分分析を施し、その第1主成分に対する固有ベクトルを基に算出した配列間の類似度から系統樹を作成する。Clustal Omega により得られる系統樹との Robinson-Foulds 距離により結果を評価し、最適なアミノ酸指標の組み合わせを求める。 | |||||||||
| 書誌レコードID | ||||||||||
| 収録物識別子タイプ | NCID | |||||||||
| 収録物識別子 | AN00349328 | |||||||||
| 書誌情報 |
第86回全国大会講演論文集 巻 2024, 号 1, p. 761-762, 発行日 2024-03-01 |
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| 出版者 | ||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||
| 出版者 | 情報処理学会 | |||||||||
