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アイテム
グラフ埋め込みと最適輸送を用いた空間的遺伝子発現情報のアラインメント
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/232804
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/232804920c1756-8e35-4a87-a93b-92e47ea090c1
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
|---|---|---|
IPSJ-MPS24147021.pdf (1.4 MB)
2026年3月1日からダウンロード可能です。
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Copyright (c) 2024 by the Information Processing Society of Japan
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| 非会員：¥660, IPSJ:学会員：¥330, MPS:会員：¥0, DLIB:会員：¥0 | ||
| Item type | SIG Technical Reports(1) | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 公開日 | 2024-02-29 | |||||||||||
| タイトル | ||||||||||||
| タイトル | グラフ埋め込みと最適輸送を用いた空間的遺伝子発現情報のアラインメント | |||||||||||
| 言語 | ||||||||||||
| 言語 | jpn | |||||||||||
| 資源タイプ | ||||||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh | |||||||||||
| 資源タイプ | technical report | |||||||||||
| 著者所属 | ||||||||||||
| 大阪大学大学院医学系研究科神経遺伝子学教室 | ||||||||||||
| 著者所属 | ||||||||||||
| 大阪大学大学院医学系研究科神経遺伝子学教室／大阪大学先導的学際研究機構生命医科学融合フロンティア研究部門 | ||||||||||||
| 著者所属 | ||||||||||||
| 大阪大学大学院医学系研究科神経遺伝子学教室／大阪大学先導的学際研究機構生命医科学融合フロンティア研究部門 | ||||||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||||||
| en | ||||||||||||
| Department of RNA Biology and Neuroscience, Graduate School of Medicine, Osaka University | ||||||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||||||
| en | ||||||||||||
| Department of RNA Biology and Neuroscience, Graduate School of Medicine, Osaka University / Institute for Open and Transdisciplinary Research Initiatives, Osaka University | ||||||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||||||
| en | ||||||||||||
| Department of RNA Biology and Neuroscience, Graduate School of Medicine, Osaka University / Institute for Open and Transdisciplinary Research Initiatives, Osaka University | ||||||||||||
| 著者名 |
杉原, 礼一
× 杉原, 礼一
× 加藤, 有己
× 河原, 行郎
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| 論文抄録 | ||||||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||||||
| 内容記述 | 空間的遺伝子発現解析は組織切片から位置情報を保持したまま網羅的に遺伝子発現の解析を行う．これにより得られる多様なデータの特徴量を抽出し，異なる切片やシングルセル RNA-seq データと比較することで，組織上での微小環境や細胞のサブタイプの詳細な解析が期待される．本稿では，グラフ埋め込みを用いた特徴量抽出と最適輸送を用いた特徴量の比較を組み合わせた解析手法を報告する．本手法を複数の実データに適用し評価を行った結果，遺伝子情報のみを用いた解析と比べ，空間情報を加えることで，より精度の高い特徴量抽出とアラインメントに成功した． | |||||||||||
| 書誌レコードID | ||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | NCID | |||||||||||
| 収録物識別子 | AN10505667 | |||||||||||
| 書誌情報 |
研究報告数理モデル化と問題解決（MPS） 巻 2024-MPS-147, 号 21, p. 1-2, 発行日 2024-02-29 |
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| ISSN | ||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | ISSN | |||||||||||
| 収録物識別子 | 2188-8833 | |||||||||||
| Notice | ||||||||||||
| SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc. | ||||||||||||
| 出版者 | ||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||
| 出版者 | 情報処理学会 | |||||||||||
