WEKO3
アイテム
相同配列情報を活用した高速なRNA二次構造予測手法の開発
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/232803
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/232803ab380739-0e52-4f46-b3dc-e716d3398485
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
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IPSJ-MPS24147020.pdf (1.1 MB)
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Copyright (c) 2024 by the Information Processing Society of Japan
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| オープンアクセス | ||
| Item type | SIG Technical Reports(1) | |||||||||||||
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| 公開日 | 2024-02-29 | |||||||||||||
| タイトル | ||||||||||||||
| タイトル | 相同配列情報を活用した高速なRNA二次構造予測手法の開発 | |||||||||||||
| 言語 | ||||||||||||||
| 言語 | jpn | |||||||||||||
| 資源タイプ | ||||||||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh | |||||||||||||
| 資源タイプ | technical report | |||||||||||||
| 著者所属 | ||||||||||||||
| 早稲田大学 | ||||||||||||||
| 著者所属 | ||||||||||||||
| 早稲田大学 | ||||||||||||||
| 著者所属 | ||||||||||||||
| 早稲田大学 | ||||||||||||||
| 著者所属 | ||||||||||||||
| 早稲田大学／AIST-Waseda University CBBD-OIL／日本医科大学 | ||||||||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||||||||
| en | ||||||||||||||
| Waseda University | ||||||||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||||||||
| en | ||||||||||||||
| Waseda University | ||||||||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||||||||
| en | ||||||||||||||
| Waseda University | ||||||||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||||||||
| en | ||||||||||||||
| Waseda University / AIST-Waseda University CBBD-OIL / | ||||||||||||||
| 著者名 |
西村, 友宏
× 西村, 友宏
× 久保, 顕登
× 福永, 津嵩
× 浜田, 道昭
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| 論文抄録 | ||||||||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||||||||
| 内容記述 | RNA 二次構造予測は RNA の構造・機能解析や創薬研究において不可欠である．RNA 二次構造予測のために多くのアルゴリズムや手法が開発されているが，計算効率や予測精度の面では課題がある．本研究では，相同配列情報を活用する RNA 二次構造予測手法である CentroidHomfold に対してビームサーチによる高速化手法を適用した．提案したアルゴリズムの実行時間と予測精度を評価し，相同配列情報を活用するメリットを活かしつつ高速に実行できることを確認した． | |||||||||||||
| 書誌レコードID | ||||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | NCID | |||||||||||||
| 収録物識別子 | AN10505667 | |||||||||||||
| 書誌情報 |
研究報告数理モデル化と問題解決（MPS） 巻 2024-MPS-147, 号 20, p. 1-3, 発行日 2024-02-29 |
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| ISSN | ||||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | ISSN | |||||||||||||
| 収録物識別子 | 2188-8833 | |||||||||||||
| Notice | ||||||||||||||
| SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc. | ||||||||||||||
| 出版者 | ||||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||||
| 出版者 | 情報処理学会 | |||||||||||||
