WEKO3
アイテム
タンパク質立体構造の木表現とGCNに基づくEC番号の推定
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/221938
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/2219389a4f4503-f0de-4f0d-b488-1665388ca577
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
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Copyright (c) 2022 by the Information Processing Society of Japan
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| Item type | National Convention(1) | |||||||||
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| 公開日 | 2022-02-17 | |||||||||
| タイトル | ||||||||||
| タイトル | タンパク質立体構造の木表現とGCNに基づくEC番号の推定 | |||||||||
| 言語 | ||||||||||
| 言語 | jpn | |||||||||
| キーワード | ||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||
| 主題 | コンピュータと人間社会 | |||||||||
| 資源タイプ | ||||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_5794 | |||||||||
| 資源タイプ | conference paper | |||||||||
| 著者所属 | ||||||||||
| 東京薬科大 | ||||||||||
| 著者所属 | ||||||||||
| 東京薬科大 | ||||||||||
| 著者名 |
青柳, 詠美
× 青柳, 詠美
× 小島, 正樹
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| 論文抄録 | ||||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||||
| 内容記述 | 当研究室で開発しているVOLTESは、タンパク質の立体構造を、系の自由度に等しい二面角座標を用いて、分子のトポロジーを反映した木構造で表現し、かつデータを6値化することにより、探索対象の構造空間を離散化している。リストの入れ子として実装したアルゴリズムを用いて、これまでタンパク質の論理的構造設計(2019)や分子進化とトポロジーとの相関解析(2020)に用いてきた。本研究ではVOLTESグラフ構造を特徴量としたグラフ畳み込みニューラルネットワーク(GCN)を用いて、立体構造から反応経路を考慮せずにEC番号を推定し、VOLTESにおけるAIの利用可能性を評価した。 | |||||||||
| 書誌レコードID | ||||||||||
| 収録物識別子タイプ | NCID | |||||||||
| 収録物識別子 | AN00349328 | |||||||||
| 書誌情報 |
第84回全国大会講演論文集 巻 2022, 号 1, p. 969-970, 発行日 2022-02-17 |
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| 出版者 | ||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||
| 出版者 | 情報処理学会 | |||||||||