PCA・テンソル分解に碁づく教師なし特徴抽出による差次的メチル化シトシン選択 標準偏差最適化法と既存法の比較：論文内容の日本語要約

• Item type: SIG Technical Reports(1)
• 公開日: 2026-08-26
• タイトル / 言語: ja
• タイトル: PCA・テンソル分解に碁づく教師なし特徴抽出による差次的メチル化シトシン選択 標準偏差最適化法と既存法の比較：論文内容の日本語要約
• 言語: jpn
• 資源タイプ / 資源タイプ識別子: http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh
• 資源タイプ: technical report
• 著者所属: 中央大学
• 著者所属: キング・アブドゥルアズィーズ大学
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Chuo University
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): King Abdulaziz University
• 著者名: 田口,善弘; ターキー,ターキー
• 著者名(英): Y-H. Taguchi; Turki Turki
• 論文抄録 / 内容記述タイプ: Other
• 論文抄録 / 内容記述: DNAメチル化解析では、RNA-seqにおける差次的発現遺伝子解析ほど標準的な差次的メチル化シトシン（DMC）の同定法が確立していない。本論文は、主成分分析（PCA）またはテンソル分解（TD）を用いた教師なし特徴抽出（unsupervised feature extraction; FE）に、主成分スコアの標準偏差をデータ駆動的に最適化する手順を組み合わせ、DMCを選択する方法を提案する。提案法は、メチル化率自体にベータニ項分布などの複雑な分布を仮定せず、特徴側の主成分スコアが帰無仮説下でガウス分布に従うと仮定する。マイクロアレイ2データセット、ハイスループット・シーケンシング（HTS）2データセット、およびTCGA乳癌・大腸癌データで評価した結果、既知DMR、エンハンサー、DNase I高感受性部位（DHS）との重なり、DMRへの統合、機能富化解析のいずれでも妥当性が示された。特にHTSではDSS、DMRcate、metileneより安定してDMCを同定し、少数標本にも適用できる可能性が示された。一方、偽陽性が無視できないこと、HTSの評価に共通の背景集合を置けないことなどが限界として残る。
• 書誌レコードID / 収録物識別子タイプ: NCID
• 書誌レコードID / 収録物識別子: AA12055912
• 書誌情報: 研究報告バイオ情報学（BIO）; 巻 2026-BIO-86, 号 6, p. 1-6, 発行日 2026-08-26
• ISSN / 収録物識別子タイプ: ISSN
• ISSN / 収録物識別子: 2188-8590
• Notice: SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc.
• 出版者 / 言語: ja
• 出版者: 情報処理学会