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  1. 研究報告
  2. バイオ情報学(BIO)
  3. 2025
  4. 2025-BIO-83

コラーゲン-グリコサミノグリカンメッシュが遺伝子発現に及ぼす影響の要約 PCAに基づく教師なし特徴抽出による再解析

https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/2004566
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/2004566
6d8d51c8-d912-4fe4-9f39-4b9530398929
名前 / ファイル ライセンス アクション
IPSJ-BIO25083001.pdf IPSJ-BIO25083001.pdf (941.8 KB)
 2027年10月16日からダウンロード可能です。
Copyright (c) 2025 by the Information Processing Society of Japan
非会員:¥660, IPSJ:学会員:¥330, BIO:会員:¥0, DLIB:会員:¥0
Item type SIG Technical Reports(1)
公開日 2025-10-16
タイトル
言語 ja
タイトル コラーゲン-グリコサミノグリカンメッシュが遺伝子発現に及ぼす影響の要約 PCAに基づく教師なし特徴抽出による再解析
言語
言語 jpn
資源タイプ
資源タイプ識別子 http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh
資源タイプ technical report
著者所属
中央大学
著者所属
キング・アブドゥルアズィーズ大学
著者名 田口,善弘

× 田口,善弘

田口,善弘

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ターキー,ターキー

× ターキー,ターキー

ターキー,ターキー

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論文抄録
内容記述タイプ Other
内容記述 本稿は、Taguchi & Turki,Polymers 13,4117 (2021)を元に、IMR90細胞におけるコラーゲン-グリコサミノグリカン(C-GAG)メッシュ接触の有無による遺伝子発現変動を、主成分分析(PCA)に基づく教師なし特徴抽出で評価した研究の内容を日本語で要約する。処理群では時間(1-48時間)と相関する成分が検出され、324プローブ(対応遺伝子は約318)が選抜された一方、対照群では有意な時間依存性は検出されなかった。機能アノテーションでは、アポトーシス調節、フォーカルアドヒージョン、リボソーム関連経路などが有意に富化した。線形回帰に基づく選抜は813プローブを得たが、富化の有意性や妥当性でPCA法に劣った。
書誌レコードID
収録物識別子タイプ NCID
収録物識別子 AA12055912
書誌情報 研究報告バイオ情報学(BIO)

巻 2025-BIO-83, 号 1, p. 1-8, 発行日 2025-10-16
ISSN
収録物識別子タイプ ISSN
収録物識別子 2188-8590
Notice
SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc.
出版者
言語 ja
出版者 情報処理学会
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Ver.1 2025-10-09 02:58:36.253669
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