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ゲノム解析における射影手法：テンソル分解と主成分分析の特徴選択ツールとしての理論的根拠
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/2002711
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/200271118e15bb4-a4eb-4123-867f-b51446897dc4
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
|---|---|---|
IPSJ-BIO25082035.pdf (882.1 KB)
2027年6月14日からダウンロード可能です。
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Copyright (c) 2025 by the Information Processing Society of Japan
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| 非会員：¥660, IPSJ:学会員：¥330, BIO:会員：¥0, DLIB:会員：¥0 | ||
| Item type | SIG Technical Reports(1) | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 公開日 | 2025-06-14 | |||||||||
| タイトル | ||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||
| タイトル | ゲノム解析における射影手法：テンソル分解と主成分分析の特徴選択ツールとしての理論的根拠 | |||||||||
| 言語 | ||||||||||
| 言語 | jpn | |||||||||
| キーワード | ||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||
| 主題 | バイオ情報学（IPSJ-BIO）1 | |||||||||
| 資源タイプ | ||||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh | |||||||||
| 資源タイプ | technical report | |||||||||
| 著者所属 | ||||||||||
| 中央大学 | ||||||||||
| 著者所属 | ||||||||||
| キング・アブドゥルアズィーズ大学 | ||||||||||
| 著者名 |
田口,善弘
× 田口,善弘
× ターキー,ターキー
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| 論文抄録 | ||||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||||
| 内容記述 | 本レポートは、Y-h. TaguchiとTurki Turkiによる論文「Projection in genomic analysis: A theoretical basis to rationalize tensor decomposition and principal component analysis as feature selection tools [1]」を基に、ゲノム解析における射影追跡（PP）、主成分分析（PCA）、およびテンソル分解（TD）に基づく非教師特徴抽出（FE）の理論的根拠をまとめる。これらの手法は、統計的検定に基づく従来の手法と比較して優れた性能を示すが、その理由は不明であった。本研究では、PPを用いてPCAおよびTDの成功を理論的に説明し、3つのデータセット（腎臓がんのバイオマーカー特定とCOVID-19の創薬）への適用を通じて検証する。結果として、PCAおよびTDがK-meansクラスタリングのセントロイド部分空間に対応し、生物学的に意味のある遺伝子選択を可能にすることが示された。また、シャッフリングによるヌル分布を用いた検証により、閾値の妥当性が確認された。 | |||||||||
| 書誌レコードID | ||||||||||
| 収録物識別子タイプ | NCID | |||||||||
| 収録物識別子 | AA12055912 | |||||||||
| 書誌情報 |
研究報告バイオ情報学（BIO） 巻 2025-BIO-82, 号 35, p. 1-5, 発行日 2025-06-14 |
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| ISSN | ||||||||||
| 収録物識別子タイプ | ISSN | |||||||||
| 収録物識別子 | 2188-8590 | |||||||||
| Notice | ||||||||||
| SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc. | ||||||||||
| 出版者 | ||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||
| 出版者 | 情報処理学会 | |||||||||
