スペクトル法によるタンパク質相互作用ネットワークのモジュール分解

• Item type: SIG Technical Reports(1)
• 公開日: 2009-05-18
• タイトル: スペクトル法によるタンパク質相互作用ネットワークのモジュール分解
• タイトル / 言語: en
• タイトル: Modular decomposition based spectrum for protein-protein interaction network
• 言語: jpn
• 資源タイプ / 資源タイプ識別子: http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh
• 資源タイプ: technical report
• 著者所属: 九州工業大学大学院
• 著者所属: 江南大学
• 著者所属: 九州工業大学大学院
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Department of Bioscience and Bioinformatics, Kyushu Institute of Technology
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): School of Biotechnology, Southern Yangtze University
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Department of Bioscience and Bioinformatics, Kyushu Institute of Technology
• 著者名: 井上, 健太郎; Weijiang, Li; 倉田, 博之
• 著者名(英): Kentaro, Inoue; Weijiang, Li; Hiroyuki, Kurata
• 論文抄録 / 内容記述タイプ: Other
• 論文抄録 / 内容記述: タンパク質相互作用 (PPI) ネットワークをモジュール分解するためにさまざまクラスタリング法が提案されているが、高速に正確なモジュールを発見する手法が確立されていない。本研究では、従来のスペクトル法に新規のベキ乗因子を加えることで、複雑なネットワークのわずかな幾何学的差を見いだし、クラスタに分解することができた。 PPI に存在する生体機能モジュールを位相幾何学的に見つけ出すための手法を開発した。
• 論文抄録(英) / 内容記述タイプ: Other
• 論文抄録(英) / 内容記述: A method for the division of a protein-protein interaction (PPI) network into functional modules is proposed, since there have been few methods for discovering functional modules at a high speed. In this study, we develop the new spectral analysis method that implements a power factor to identify the cluster structures of complex networks. It can separate the PPI networks into topologically meaningful modules with biological functions.
• 書誌レコードID / 収録物識別子タイプ: NCID
• 書誌レコードID / 収録物識別子: AA12055912
• 書誌情報: 研究報告バイオ情報学（BIO）; 巻 2009-BIO-17, 号 14, p. 1-4, 発行日 2009-05-18
• Notice: SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc.
• 出版者 / 言語: ja
• 出版者: 情報処理学会