0HFデータから整列クローン・ライブラリーを求める方法

• Item type: SIG Technical Reports(1)
• 公開日: 1992-09-08
• タイトル: 0HFデータから整列クローン・ライブラリーを求める方法
• タイトル / 言語: en
• タイトル: A METHOD FOR CONSTRUCTION OF ORDERED CLONE LIBRARY FROM OHF DATA
• 言語: jpn
• 資源タイプ / 資源タイプ識別子: http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh
• 資源タイプ: technical report
• 著者所属: 東京大学教養学部物理学教室
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Institute of Physics, College of Arts and Sciences, The University of Tokyo
• 著者名: 陶山, 明
• 著者名(英): Akira, Suyama
• 論文抄録 / 内容記述タイプ: Other
• 論文抄録 / 内容記述: 我々は、ヒトゲノムの全塩基配列を決定するために、オリゴヌクレオチド・ハイブリダイゼーション・フィンガープリント(）から、整列されたゲノムDNAライブラリを構築する方法を開発した。MOFと呼ばれる我々の方法は、IMBという巨大なゲノムDNA断片を含むクローンに適用することが出来る。また、大量のクローンを自動化機械で処理するのにも適している。長さ470kbの人工的なゲノムを用いたシミュレーションの結果、MOF法により実用上満足できる正確さでクローンの整列が行なえることが示された。また、MOF法はOHFの実験データに常に含まれる実験誤差に対して強い方法であることがわかった。
• 論文抄録(英) / 内容記述タイプ: Other
• 論文抄録(英) / 内容記述: We have developed a method for constructing ordered genomic DNA libraries from oligonucleotide hybridization fingerprints (OHF) to accomplish the whole genome sequencing of human genome. Our method, MOF (Mapping by Oligonucleotide Fingerprints), can be applied to large clones containing 1 Mb genomic DNA fragments. It is also suitable for processing numbers of clones on automated systems. The computer simulation for 470 kb artificial genome demonstrated that clones can be actually ordered by MOF with practically satisfactory accuracy. The simulation experiments also demonstrated that MOF is highly resistant to experimental errors always included in actual OHF data.
• 書誌レコードID / 収録物識別子タイプ: NCID
• 書誌レコードID / 収録物識別子: AN10114171
• 書誌情報: 情報処理学会研究報告情報学基礎（FI）; 巻 1992, 号 68(1992-FI-027), p. 57-62, 発行日 1992-09-08
• Notice: SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc.
• 出版者 / 言語: ja
• 出版者: 情報処理学会