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タンパク質言語モデルを利用した抗生物質耐性メカニズムの予測
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/226502
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/2265024b73c799-7472-457f-9605-14b9c50c40ca
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
|---|---|---|
IPSJ-MPS23143034.pdf (864.1 kB)
2025年6月22日からダウンロード可能です。
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Copyright (c) 2023 by the Information Processing Society of Japan
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| 非会員：¥660, IPSJ:学会員：¥330, MPS:会員：¥0, DLIB:会員：¥0 | ||
| Item type | SIG Technical Reports(1) | |||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 公開日 | 2023-06-22 | |||||||||||||
| タイトル | ||||||||||||||
| タイトル | タンパク質言語モデルを利用した抗生物質耐性メカニズムの予測 | |||||||||||||
| 言語 | ||||||||||||||
| 言語 | jpn | |||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||
| 主題 | バイオ情報学1 | |||||||||||||
| 資源タイプ | ||||||||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh | |||||||||||||
| 資源タイプ | technical report | |||||||||||||
| 著者所属 | ||||||||||||||
| 早稲田大学 | ||||||||||||||
| 著者所属 | ||||||||||||||
| 日立製作所基礎研究センタ | ||||||||||||||
| 著者所属 | ||||||||||||||
| 日立製作所基礎研究センタ | ||||||||||||||
| 著者所属 | ||||||||||||||
| 早稲田大学／産総研・早稲田大学CBBD-OIL | ||||||||||||||
| 著者名 |
柳本, 香菜美
× 柳本, 香菜美
× 細田, 至温
× 佐藤, 美和
× 浜田, 道昭
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| 論文抄録 | ||||||||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||||||||
| 内容記述 | 抗生物質は細菌感染症の治療に広く用いられているが，耐性菌による被害が世界的な問題となっている．抗生物質耐性菌は，病原菌が環境中の抗生物質耐性遺伝子（Antibiotic Resistance Genes：ARG）を獲得することで出現することがある．そのため，環境中の ARG を特定することが耐性菌対策の第一歩である．そこで本研究ではタンパク質言語モデルを利用し，ARG の特定と耐性の発現メカニズムの予測を行うモデルを開発した．その結果，提案モデルは既存モデルより高い精度を示した他，i）未知の ARG に対する高い汎化能力を持っていること，ii）学習に用いている Attention によって ARG 内の抗生物質結合部位を認識できることを示唆した． | |||||||||||||
| 書誌レコードID | ||||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | NCID | |||||||||||||
| 収録物識別子 | AN10505667 | |||||||||||||
| 書誌情報 |
研究報告数理モデル化と問題解決（MPS） 巻 2023-MPS-143, 号 34, p. 1-2, 発行日 2023-06-22 |
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| ISSN | ||||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | ISSN | |||||||||||||
| 収録物識別子 | 2188-8833 | |||||||||||||
| Notice | ||||||||||||||
| SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc. | ||||||||||||||
| 出版者 | ||||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||||
| 出版者 | 情報処理学会 | |||||||||||||
