KampoDBをより使いやすくするための大幅更新

• Item type: SIG Technical Reports(1)
• 公開日: 2022-03-03
• タイトル: KampoDBをより使いやすくするための大幅更新
• タイトル / 言語: en
• タイトル: A major update of KampoDB for better usability
• 言語: jpn
• 資源タイプ / 資源タイプ識別子: http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh
• 資源タイプ: technical report
• 著者所属: 富山大学和漢医薬学総合研究所
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Institute of Natural Medicine, University of Toyama
• 著者名: 奥, 牧人
• 著者名(英): Makito, Oku
• 論文抄録 / 内容記述タイプ: Other
• 論文抄録 / 内容記述: 本稿では，富山大学和漢医薬学総合研究所が管理しているKampoDBというデータベースをより使いやすくするために実施した，直近の大幅更新の内容について紹介する．このデータベースは，漢方処方，生薬，天然化合物，蛋白質などの関係をまとめたものである．主な変更点は，ページ毎に固有のURLを割り当てたこと，低分子化合物と蛋白質の組のページを除きどのページも一つの検索ボックスで検索出来るようにしたこと，要素数の多い一覧を分割表示にしたこと，分子描画に用いるライブラリをJSmolから3Dmol.jsに変えたこと，元々3つに分かれていたデータベースの内容を1つにまとめたこと，低分子化合物と蛋白質の結合強度を6段階表示にしたことである．1日当たりの平均ページ閲覧数は更新前の9.3回から17.3回に増え，改善の効果が示唆されている．
• 論文抄録(英) / 内容記述タイプ: Other
• 論文抄録(英) / 内容記述: In this paper, I introduce the contents of the latest major update of KampoDB, a database maintained by Institute of Natural Medicine, University of Toyama, which has been done for better usability. The database summarizes the relationships between kampo formulas, crude drugs, natural compounds, proteins, and so on. The major changes are: assigned a unique URL to each page, enabled to search any page in one search box except for ligand-protein pages, introduced pagination, changed the molecular visualization library from JSmol to 3Dmol.js, integrated the database contents into one that was originally divided into three, and displayed the binding strength between a small molecule and a protein in six levels. The average number of daily page views has increased from 9.3 before the update to 17.3, indicating the effect of the improvement.
• 書誌レコードID / 収録物識別子タイプ: NCID
• 書誌レコードID / 収録物識別子: AA12055912
• 書誌情報: 研究報告バイオ情報学（BIO）; 巻 2022-BIO-69, 号 14, p. 1-6, 発行日 2022-03-03
• ISSN / 収録物識別子タイプ: ISSN
• ISSN / 収録物識別子: 2188-8590
• Notice: SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc.
• 出版者 / 言語: ja
• 出版者: 情報処理学会