分子動力学計算によるUCH-L1変異体の構造変化予測

• Item type: SIG Technical Reports(1)
• 公開日: 2012-08-02
• タイトル: 分子動力学計算によるUCH-L1変異体の構造変化予測
• タイトル / 言語: en
• タイトル: Aberrant structures of ubiquitin C-terminal hydrolase L1 variants predicted by molecular dynamics simulations
• 言語: jpn
• 資源タイプ / 資源タイプ識別子: http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh
• 資源タイプ: technical report
• 著者所属: 九州工業大学大学院情報工学府情報科学専攻生命情報分野
• 著者所属: 九州工業大学大学院情報工学府情報科学専攻生命情報分野
• 著者所属: 九州工業大学大学院情報工学府情報科学専攻生命情報分野
• 著者所属: 九州工業大学大学院情報工学府情報科学専攻生命情報分野／九州工業大学バイオメディカルインフォマティクス研究開発センター
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Department of Bioscience and Bioinformatics, Graduate School of Computer Science and System Engineering, Kyushu Institute of Technology
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Department of Bioscience and Bioinformatics, Graduate School of Computer Science and System Engineering, Kyushu Institute of Technology
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Department of Bioscience and Bioinformatics, Graduate School of Computer Science and System Engineering, Kyushu Institute of Technology
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Department of Bioscience and Bioinformatics, Graduate School of Computer Science and System Engineering, Kyushu Institute of Technology / Biomedical Informatics R&D Center, Kyushu Institute of Technology
• 著者名: 小関, 祐司; 金城, 知広; 黒木, 理人; 青木, 俊介
• 著者名(英): Yuji, Koseki; Tomohiro, Kinjo; Masato, Kuroki; Shunsuke, Aoki
• 論文抄録 / 内容記述タイプ: Other
• 論文抄録 / 内容記述: UCH-L1は神経特異的な脱ユビキチン化酵素で，S18Y，I93M変異はパーキンソン病発病リスクに関連している．未だ解明されていないアミノ酸変異によるタンパク質変性メカニズムを予測するために，分子動力学計算を行った．その結果，それらの変性構造を予測することに成功し，さらに，I93M変異型は野生型と比較して不安定な分子運動を示すことを明らかにした．
• 論文抄録(英) / 内容記述タイプ: Other
• 論文抄録(英) / 内容記述: Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase L1 (UCH-L1) is a neuron-specific deubiquitinating enzyme. Single amino acid changes (S18Y and I93M) within UCH-L1 are associated with risk of Parkinson's disease. In this study, we attempted to predict these protein denaturation mechanism based on molecular dynamics (MD) simulations. We succeeded in predicting the three-dimensional structures of the UCH-L1 variants in aqueous solution. Moreover, we revealed that I93M UCH-L1 exhibit disordered directional motion compared with WT UCH-L1.
• 書誌レコードID / 収録物識別子タイプ: NCID
• 書誌レコードID / 収録物識別子: AA12055912
• 書誌情報: 研究報告バイオ情報学（BIO）; 巻 2012-BIO-30, 号 12, p. 1-2, 発行日 2012-08-02
• Notice: SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc.
• 出版者 / 言語: ja
• 出版者: 情報処理学会