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アイテム
結晶スクリーニング結果を活用した機械学習による結晶化条件の予測モデルアレイ
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/58888
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/588880ff9e47e-116c-49ca-89df-5b271514ef44
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
|---|---|---|
IPSJ-BIO08013011.pdf (1.5 MB)
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Copyright (c) 2008 by the Information Processing Society of Japan
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| オープンアクセス | ||
| Item type | SIG Technical Reports(1) | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 公開日 | 2008-06-19 | |||||||
| タイトル | ||||||||
| タイトル | 結晶スクリーニング結果を活用した機械学習による結晶化条件の予測モデルアレイ | |||||||
| タイトル | ||||||||
| 言語 | en | |||||||
| タイトル | Developing a prediction array of crystallization condition models from screening trial results by machine learning method | |||||||
| 言語 | ||||||||
| 言語 | jpn | |||||||
| 資源タイプ | ||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh | |||||||
| 資源タイプ | technical report | |||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 東京工業大学大学院情報理工学研究科／東京大学大学院理学系研究科 | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 理化学研究所横浜研究所生命分子システム基盤研究領域 | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 理化学研究所横浜研究所生命分子システム基盤研究領域 | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 理化学研究所横浜研究所生命分子システム基盤研究領域／群馬大学大学院工学研究科 | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 東京工業大学大学院情報理工学研究科 | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 理化学研究所横浜研究所生命分子システム基盤研究領域／東京大学大学院理学系研究科 | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 理化学研究所横浜研究所生命情報基盤研究部門 | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 理化学研究所横浜研究所生命分子システム基盤研究領域／東北大学大学院医工学研究科 | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Tokyo Institute of Technology / The Univ. of Tokyo, Graduate School of Science | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| RIKEN Yokohama Institute, SSBC | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| RIKEN Yokohama Institute, SSBC | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| RIKEN Yokohama Institute, SSBC / Gunma Univ., Graduate School of Engineering | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Tokyo Institute of Technology | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| RIKEN Yokohama Institute, SSBC / The Univ. of Tokyo, Graduate School of Science | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| RIKEN Yokohama Institute, BASE | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| RIKEN Yokohama Institute, SSBC / Tohoku Univ., School of Biomedical Engineering | ||||||||
| 著者名 |
小西, 史一
竹本, 千重
赤坂, 領吾
行木信一
秋山, 泰
横山, 茂之
豊田, 哲郎
村山, 和隆
× 小西, 史一 竹本, 千重 赤坂, 領吾 行木信一 秋山, 泰 横山, 茂之 豊田, 哲郎 村山, 和隆
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| 著者名(英) |
Fumikazu, Konishi
Chie, Takemoto
Ryogo, Akasaka
Nobukazu, Nameki
Yutaka, Akiyama
Shigeyuki, Yokoyama
Tetsuro, Toyoda
Kazutaka, Murayama
× Fumikazu, Konishi Chie, Takemoto Ryogo, Akasaka Nobukazu, Nameki Yutaka, Akiyama Shigeyuki, Yokoyama Tetsuro, Toyoda Kazutaka, Murayama
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| 論文抄録 | ||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||
| 内容記述 | タンパク質の結晶構造解析は、生体高分子の働きを知る有用な手段であり、学術的にも応用的にも構造決定の重要性が高まっている。このようなタンパク質に関する基本構造の決定を目指したタンパク 3000 プロジェクト[1] では、高等生物の機能ドメインや小型タンパク質の構造解析には NMR を用い、より大きいタンパク質の構造解析にはＸ線による結晶回折を主に用いて解析を行ってきた。近年このＸ 線結晶構造解析分野でのソフト・ハードの発展は、顕著な効率化を実現しつつある一方で、結晶化のプロセスは、未だ試行錯誤的な経験的アプローチに終始しており、タンパク質一つの結晶化に数百から千を超える条件を実際に試すことも稀ではない。つまり、現在のタンパク質の結晶構造解析においては、その結晶化がボトルネックとなっており、結晶化プロセスの合理化は、多数の構造を知る上で急務の課題であると広く認識されている。これまで、系統的に行われた精製実験や結晶化実験における成否情報（アミノ酸配列、発現、可溶化、結晶化溶液の条件検討、そして結晶化の有無等）は、質の高い実験データベースとして蓄積されており、この情報に対して Support Vector Machine (SVM)[2] などの数理情報科学手法を適用することで、未知のタンパクに対してスクリーニング条件を絞り込む支援を行うシステムの開発を実施することを目的としている。 | |||||||
| 書誌レコードID | ||||||||
| 収録物識別子タイプ | NCID | |||||||
| 収録物識別子 | AA12055912 | |||||||
| 書誌情報 |
情報処理学会研究報告バイオ情報学（BIO） 巻 2008, 号 58(2008-BIO-013), p. 49-54, 発行日 2008-06-19 |
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| Notice | ||||||||
| SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc. | ||||||||
| 出版者 | ||||||||
| 言語 | ja | |||||||
| 出版者 | 情報処理学会 | |||||||
