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  1. 研究報告
  2. バイオ情報学(BIO)
  3. 2008
  4. 86(2008-BIO-014)

構造キーの分割によるTanimoto係数を用いた化合物検索の計算範囲の絞り込み手法

https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/58866
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/58866
568d3d9c-df8f-4513-83c3-bafe93b3c420
名前 / ファイル ライセンス アクション
IPSJ-BIO08014002.pdf IPSJ-BIO08014002.pdf (653.0 kB)
Copyright (c) 2008 by the Information Processing Society of Japan
オープンアクセス
Item type SIG Technical Reports(1)
公開日 2008-09-11
タイトル
タイトル 構造キーの分割によるTanimoto係数を用いた化合物検索の計算範囲の絞り込み手法
タイトル
言語 en
タイトル A method for refinement of the calculation range by divided structure key of the compound search using Tanimoto coefficient
言語
言語 jpn
資源タイプ
資源タイプ識別子 http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh
資源タイプ technical report
著者所属
大阪大学大学院情報科学研究科バイオ情報工学専攻
著者所属
大阪大学臨床医工学融合教育センター
著者所属
大阪大学大学院情報科学研究科バイオ情報工学専攻
著者所属
大阪大学大学院情報科学研究科バイオ情報工学専攻
著者所属
大阪大学大学院情報科学研究科バイオ情報工学専攻
著者所属(英)
en
Department of Bioinformatic Engineering, Graduate School of Information Science and Technology, Osaka University
著者所属(英)
en
The Center for Advanced Medical Engineering and Informatics, Osaka University
著者所属(英)
en
Department of Bioinformatic Engineering, Graduate School of Information Science and Technology, Osaka University
著者所属(英)
en
Department of Bioinformatic Engineering, Graduate School of Information Science and Technology, Osaka University
著者所属(英)
en
Department of Bioinformatic Engineering, Graduate School of Information Science and Technology, Osaka University
著者名 清水, 隆史 木戸, 善之 瀬尾, 茂人 竹中, 要一 松田, 秀雄

× 清水, 隆史 木戸, 善之 瀬尾, 茂人 竹中, 要一 松田, 秀雄

清水, 隆史
木戸, 善之
瀬尾, 茂人
竹中, 要一
松田, 秀雄

Search repository
著者名(英) Takashi, Shimizu Yoshiyuki, Kido Shigeto, Seno Yoichi, Takenaka Hideo, Matsuda

× Takashi, Shimizu Yoshiyuki, Kido Shigeto, Seno Yoichi, Takenaka Hideo, Matsuda

en Takashi, Shimizu
Yoshiyuki, Kido
Shigeto, Seno
Yoichi, Takenaka
Hideo, Matsuda

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論文抄録
内容記述タイプ Other
内容記述 化合物データベースに登録されている化合物数は増加の一途をたどっている.化合物データベースの類似性検索では,構造キーと Tanimoto 係数を用いた検索がよく利用されるが,化合物数の増加に伴い検索にかかる時間が増加する.そこで本研究では,構造キーを分割することで類似性検索の計算範囲を絞り込む手法を提案し,実際の化合物データベースでの検索の際の計算回数を測定することによりその有効性を示した.
論文抄録(英)
内容記述タイプ Other
内容記述 The amount of compounds in public databases goes on increasing. A structure key and Tanimoto coefficient are often used for similarity searches in compound databases. As the number of compounds increases, the search time increases. In this research, we propose a method for refinement of the calculation range by divided structure key, and show the effectiveness by measuring the number of calculation with the data of database.
書誌レコードID
収録物識別子タイプ NCID
収録物識別子 AA12055912
書誌情報 情報処理学会研究報告バイオ情報学(BIO)

巻 2008, 号 86(2008-BIO-014), p. 5-8, 発行日 2008-09-11
Notice
SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc.
出版者
言語 ja
出版者 情報処理学会
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Ver.1 2025-01-22 03:50:18.242397
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