知識を用いた蛋白質の配列解析の試み

• Item type: SIG Technical Reports(1)
• 公開日: 1992-09-08
• タイトル: 知識を用いた蛋白質の配列解析の試み
• タイトル / 言語: en
• タイトル: Formulation of PROTEIN SEQUENCE ANALYSIS using Knowledge
• 言語: jpn
• 資源タイプ / 資源タイプ識別子: http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh
• 資源タイプ: technical report
• 著者所属: （財）新世代コンピュータ技術開発機構
• 著者所属: （財）新世代コンピュータ技術開発機構
• 著者所属: （財）新世代コンピュータ技術開発機構
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): ICOT
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): ICOT
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): ICOT
• 著者名: 広沢, 誠; 星田, 昌紀; 石川, 幹人
• 著者名(英): Makoto, Hirosawa; Masaki, Hoshida; Masato, Ishikawa
• 論文抄録 / 内容記述タイプ: Other
• 論文抄録 / 内容記述: 蛋白質の機能解析や生物の系統樹を書くために、蛋白質をマルチプルアライメント（配列解析）を作成することは重要な技術である。このため従来から、様々なマルチプルアライメントのアルゴリズムが開発されてきた。しかしながら、これらのアルゴリズムは計算機的に設定された評価値を最適化するものであり、生物学的に妥当なマルチプルアライメントとは必ずしも一致しない。我々は、マルチプルアライメントの専門家にインタビューし、彼らがマルチプルアライメントを作成する際に意識、無意識的に使用しているアライメントルール、生物学的知識を抽出した。そして、それらの解析結果に基づき、マルチプルアライメントシステムを試作した。
• 論文抄録(英) / 内容記述タイプ: Other
• 論文抄録(英) / 内容記述: Protein sequence analysis is used to predict the structure of protein and to draw the phylogenic tree of creatures. Multiple alignment is one of the essential technique for analyzing the protein sequence. And various algorithms for multiple alignment have been developed. But, because such algorithms try to optimize some evaluation function for multiple alignment, the multiple alignment they produce are not necessarily biologically optima. We interviewed experts on multiple alignment and extracted the alignment rules and biological knowledge which they use to make multiple alignment. Based on analysis of these result, we formulated and constructed multiple alignment system.
• 書誌レコードID / 収録物識別子タイプ: NCID
• 書誌レコードID / 収録物識別子: AN10114171
• 書誌情報: 情報処理学会研究報告情報学基礎（FI）; 巻 1992, 号 68(1992-FI-027), p. 1-12, 発行日 1992-09-08
• Notice: SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc.
• 出版者 / 言語: ja
• 出版者: 情報処理学会