コンパクトクラスタを利用した分子軌道計算の性能評価

• Item type: SIG Technical Reports(1)
• 公開日: 2007-03-01
• タイトル: コンパクトクラスタを利用した分子軌道計算の性能評価
• タイトル / 言語: en
• タイトル: Implementation and Evaluation of Molecular Orbital Calculations Program on a Compact Cluster
• 言語: jpn
• 資源タイプ / 資源タイプ識別子: http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh
• 資源タイプ: technical report
• 著者所属: 大阪府立工業高等専門学校
• 著者所属: アプリオリマイクロシステムズ
• 著者所属: 産業技術総合研究所
• 著者所属: 産業技術総合研究所
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Osaka Prefectural College of Technology
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): A-Priori Microsystems Ltd
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): National Institute of Advanced Industrial Science and Technology
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): National Institute of Advanced Industrial Science and Technology
• 著者名: 早川, 潔; 佐々木, 徹; 梅田, 宏明; 長嶋, 雲兵
• 著者名(英): Kiyoshi, Hayakawa; Tohru, Sasaki; Hiroaki, Umeda; Umpei, Nagashima
• 論文抄録 / 内容記述タイプ: Other
• 論文抄録 / 内容記述: ハイパフォーマンスアプリケーションであるHF法を用いた分子軌道計算プログラムにおいて，全体の実行時間の約99%の時間をFock行列生成に費やされている．分子軌道計算プログラムをはじめとするハイパフォーマンスアプリケーションを低消費電力かつ省スペースで実行するために，我々は組み込み部品を利用したコンパクトクラスタ（EMDCシステム）を開発し，その上で並列Fock行列生成プログラムを実装するための通信ライブラリを開発した．EMDCシステム上で，並列Fock行列プログラムを２種類（動的負荷分散および静的負荷分散）を実行した結果，どちらのプログラムもFock行列生成において90%以上の高い並列化効率を示した．特に，動的負荷分散では，EMDCシステムのようなヘテロクラスタシステムで有効であることが実証された．
• 論文抄録(英) / 内容記述タイプ: Other
• 論文抄録(英) / 内容記述: In molecular orbital calculations, one of the high performance applications, execution time of Fock matrix construction is approximately 99% of all execution time. We are developing a compact embedded cluster (called EMDC), and a communication method on it for a parallel Fock matrix construction program . The parallel Fock matrix construction program was developed on EHPC project, and EMDC has been developing for low power, small space and rapid prototyping. Network architecture (tree-base network) of EMDC conforms to parallel Fock matrix construction program. In order to communicate among the system, we developed a communication library for tree-base network. In evaluations, two parallelizing methods were executed on EMDC. Specially, the dynamic task distribution method shows high paralellization efficiency on hetero cluster like EMDC system.
• 書誌レコードID / 収録物識別子タイプ: NCID
• 書誌レコードID / 収録物識別子: AN10463942
• 書誌情報: 情報処理学会研究報告ハイパフォーマンスコンピューティング（HPC）; 巻 2007, 号 17(2007-HPC-109), p. 1-6, 発行日 2007-03-01
• Notice: SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc.
• 出版者 / 言語: ja
• 出版者: 情報処理学会