@techreport{oai:ipsj.ixsq.nii.ac.jp:00027207, author = {岩岡, 洋 and 長名, 保範 and 福島, 知紀 and 吉見, 真聡 and 舟橋, 啓 and 広井, 賀子 and 柴田, 裕一郎 and 岩永, 直樹 and 北野, 宏明 and 天野, 英晴 and Yow, Iwaoka and Yasunori, Osana and Tomonori, Fukushima and Masato, Yoshimi and Akira, Hunahashi and Noriko, Hiroi and Yuichiro, Shibata and Naoki, Iwanaga and Hiroaki, Kitano and Hideharu, Amano}, issue = {8(2004-SLDM-118)}, month = {Jan}, note = {近年、細胞内の化学反応機構のシミュレーションに関する研究が盛んである。しかし、大規模なモデルを扱う場合、膨大な計算時間を要するため、FPGAを用いてシミュレーションを高速化する研究が行われている。これまでに開発された多くのシミュレータは、SBMLと呼ばれるモデル記述言語が標準的に利用しており、互換性を保つことが重要である。本研究報告では、SBMLで記述されたモデルをFPGAで記述されたモデルをFPGA上での効率的な処理を行うシミュレーション環境のための一部ソフトウェアを実装し、評価を取った。, Computer simulation in widely used in biochemistry research. However, simulating large-scale model requires a large computational time. To reduce it, we have been developing a FPGA-based high-speed simulator, but previous research mainly forcues on high speed implementation, and standard model for description has not been prepared. SBML model, that is a standard modeling language for biochemical networks, has been popular in many software simulator. In this reseach report, an environment of FPGA-based simulator which can use SBML for modeling is implemented and evaluated.}, title = {SBML対応細胞シミュレータ環境の構築}, year = {2005} }