@techreport{oai:ipsj.ixsq.nii.ac.jp:00241329,
 author = {伊藤, 天翔 and 中野, 義雄 and 宮崎, 智 and Kakeru, Ito and Yoshio, Nakano and Satoru, Miyazaki},
 issue = {1},
 month = {Nov},
 note = {SARS-CoV-2 が効率的に宿主細胞に感染するには，宿主プロテアーゼによる SARS-CoV-2 のスパイクタンパク質の開裂が必要不可欠である．現在，このような宿主プロテアーゼとして，TMPRSS2，Cathepsin L，furin など複数見つかっている．これら以外にもスパイクタンパク質を開裂することのできるプロテアーゼが存在する可能性があるが，そのようなプロテアーゼを生化学的な実験により探索することは非常に手間がかかる．したがって，in silico による解析手法の確立が求められている．また，その解析手法の出力が，開裂確率といった解釈しやすい形式で提供されることも重要であると考える．そこで，本研究では，SARS-CoV-2 のスパイクタンパク質を開裂するプロテアーゼの探索法として，Elastic Net を用いたロジスティック回帰を提案するとともに，検証した．その結果，5 分割交差検証における性能はよかったものの，生化学的な実験の結果は完全には再現できなかったことが示された．, Cleavage of the SARS-CoV-2 spike protein by host proteases is essential for SARS-CoV-2 to efficiently infect host cells. Several such host proteases have been found, including TMPRSS2, Cathepsin L, and furin. However, searching for other proteases that can cleave spike proteins by biochemical experiments is very time-consuming. Therefore, there is a need to establish an in silico analysis method. It is also essential to provide the output of the analysis method in an easily interpretable format such as cleavage probability. In this study, we proposed logistic regression using Elastic Net as a search method for proteases that cleave SARS-CoV-2 spike protein and validated the method. The results showed that although the performance in 5-fold cross-validation was good, it only partially reproduces the results of the biochemical experiments.},
 title = {SARS-CoV-2のスパイクタンパク質を開裂する新規ヒトプロテアーゼの探索法の確立},
 year = {2024}
}