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アイテム
ProtT5を用いたタンパク質クラスタリングと勾配ブースティングによる遺伝子発現データからの肺がん予測
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/234883
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/234883a25590cb-163d-4ef8-8e09-0f0376ba5c59
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
|---|---|---|
IPSJ-BIO24078056.pdf (1.0 MB)
2026年6月13日からダウンロード可能です。
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Copyright (c) 2024 by the Information Processing Society of Japan
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| 非会員：¥660, IPSJ:学会員：¥330, BIO:会員：¥0, DLIB:会員：¥0 | ||
| Item type | SIG Technical Reports(1) | |||||||||||||
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| 公開日 | 2024-06-13 | |||||||||||||
| タイトル | ||||||||||||||
| タイトル | ProtT5を用いたタンパク質クラスタリングと勾配ブースティングによる遺伝子発現データからの肺がん予測 | |||||||||||||
| 言語 | ||||||||||||||
| 言語 | jpn | |||||||||||||
| キーワード | ||||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||||
| 主題 | 数理モデル化と問題解決2 | |||||||||||||
| 資源タイプ | ||||||||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh | |||||||||||||
| 資源タイプ | technical report | |||||||||||||
| 著者所属 | ||||||||||||||
| 松江工業高等専門学校 | ||||||||||||||
| 著者所属 | ||||||||||||||
| 松江工業高等専門学校 | ||||||||||||||
| 著者所属 | ||||||||||||||
| 東邦大学 | ||||||||||||||
| 著者所属 | ||||||||||||||
| 九州大学 | ||||||||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||||||||
| en | ||||||||||||||
| National Institute of Technology, Matsue College | ||||||||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||||||||
| en | ||||||||||||||
| National Institute of Technology, Matsue College | ||||||||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||||||||
| en | ||||||||||||||
| Toho University | ||||||||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||||||||
| en | ||||||||||||||
| Kyushu University | ||||||||||||||
| 著者名 |
川上, 瞬汰
× 川上, 瞬汰
× 林田, 守広
× ナチェル, ホセ
× 丸山, 修
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| 論文抄録 | ||||||||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||||||||
| 内容記述 | 気管支上皮細胞から取得した遺伝子発現データから肺がんを予測する大規模言語モデルを応用した機械学習手法を考察する．膨大なタンパク質アミノ酸配列から学習された ProtT5 モデルを用いて各遺伝子に対応するタンパク質をベクトルへ変換し，クラスタリングする．同じクラスタに分類された遺伝子を発現量の平均値を取ることでまとめ，勾配ブースティングによって肺がん予測を行う．クラスタ数を変化させ予測精度を比較する． | |||||||||||||
| 書誌レコードID | ||||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | NCID | |||||||||||||
| 収録物識別子 | AA12055912 | |||||||||||||
| 書誌情報 |
研究報告バイオ情報学（BIO） 巻 2024-BIO-78, 号 56, p. 1-2, 発行日 2024-06-13 |
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| ISSN | ||||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | ISSN | |||||||||||||
| 収録物識別子 | 2188-8590 | |||||||||||||
| Notice | ||||||||||||||
| SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc. | ||||||||||||||
| 出版者 | ||||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||||
| 出版者 | 情報処理学会 | |||||||||||||
