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アイテム
構造ベーススクリーニングに適したAlphaFoldタンパク質構造生成の最適化
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/234843
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/2348434a3cc908-5b85-4701-9f92-4ab7b5e7f13d
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
|---|---|---|
IPSJ-BIO24078016.pdf (3.0 MB)
2026年6月13日からダウンロード可能です。
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Copyright (c) 2024 by the Information Processing Society of Japan
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| 非会員：¥660, IPSJ:学会員：¥330, BIO:会員：¥0, DLIB:会員：¥0 | ||
| Item type | SIG Technical Reports(1) | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 公開日 | 2024-06-13 | |||||||||||
| タイトル | ||||||||||||
| タイトル | 構造ベーススクリーニングに適したAlphaFoldタンパク質構造生成の最適化 | |||||||||||
| 言語 | ||||||||||||
| 言語 | jpn | |||||||||||
| キーワード | ||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||
| 主題 | バイオ情報学1 | |||||||||||
| 資源タイプ | ||||||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh | |||||||||||
| 資源タイプ | technical report | |||||||||||
| 著者所属 | ||||||||||||
| 東京工業大学情報理工学院情報工学系 | ||||||||||||
| 著者所属 | ||||||||||||
| 東京工業大学情報理工学院情報工学系 | ||||||||||||
| 著者所属 | ||||||||||||
| 東京工業大学情報理工学院情報工学系 | ||||||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||||||
| en | ||||||||||||
| Department of Computer Science, School of Computing, Tokyo Institute of Technology | ||||||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||||||
| en | ||||||||||||
| Department of Computer Science, School of Computing, Tokyo Institute of Technology | ||||||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||||||
| en | ||||||||||||
| Department of Computer Science, School of Computing, Tokyo Institute of Technology | ||||||||||||
| 著者名 |
内河, 慶輔
× 内河, 慶輔
× 古井, 海里
× 大上, 雅史
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| 論文抄録 | ||||||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||||||
| 内容記述 | タンパク質の立体構造情報を用いた構造ベースバーチャルスクリーニングは，他手法と比べて新規性の高い薬剤候補化合物を発見しやすいなどの利点がある．一方で，使用する標的タンパク質の立体構造によってスクリーニング精度が大きく変化するという問題があり，一般的に単体構造である apo 体よりもリガンドとの複合体構造である holo 体を用いた方が精度は良いが，予測された立体構造については結果は未知であった．そこで，本研究では，タンパク質立体構造予測の代表的な手法である AlphaFold2 と SBVS の組み合わせに注目し，AlphaFold2 での予測に用いられるパラメータを遺伝的アルゴリズムを使用して最適化することで，予測構造を利用した SBVS の精度改善を図る方法を検討した． | |||||||||||
| 書誌レコードID | ||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | NCID | |||||||||||
| 収録物識別子 | AA12055912 | |||||||||||
| 書誌情報 |
研究報告バイオ情報学（BIO） 巻 2024-BIO-78, 号 16, p. 1-7, 発行日 2024-06-13 |
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| ISSN | ||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | ISSN | |||||||||||
| 収録物識別子 | 2188-8590 | |||||||||||
| Notice | ||||||||||||
| SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc. | ||||||||||||
| 出版者 | ||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||
| 出版者 | 情報処理学会 | |||||||||||
