@techreport{oai:ipsj.ixsq.nii.ac.jp:00232794,
 author = {渡邉, 将太郎 and 田口, 善弘},
 issue = {11},
 month = {Feb},
 note = {scATAC-seq はクロマチンアクセシビリティを細胞の解像度をもって明らかにし，臨床における病理学や病態を理解するうえで重要である．しかしながら scATAC-seq のデータは疎らかつ巨大であるため，それらの多次元的な解析は困難である．TDbasedUFE は複数の条件下で教師なし分類が可能であるため，scATAC-seq の解析に適している．我々は TDbasedUFE を用いて，黄色ブドウ球菌による敗血症患者の末梢血単核細胞（PBMC）の scATAC-seq のデータの分析を行った．本研究では敗血症におけるメチシリン耐性黄色ブドウ球菌（MRSA）とメチシリン感化黄色ブドウ球菌（MSSA）感染の間で，異なる応答を示す遺伝子を細胞の種類ごとに抽出し，その機能を予測した．これらの結果は TDbasedUFE が scATAC-seq のデータの解析に適していることを実証した．},
 title = {TDbasedUFEを用いた黄色ブドウ球菌敗血症におけるメチシリン耐性の解析},
 year = {2024}
}