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アイテム
TDbasedUFEを用いた黄色ブドウ球菌敗血症におけるメチシリン耐性の解析
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/232760
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/2327605dde2726-c985-4755-9bb8-f3b10be35389
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
|---|---|---|
IPSJ-BIO24077011.pdf (1.8 MB)
2026年3月1日からダウンロード可能です。
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Copyright (c) 2024 by the Information Processing Society of Japan
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| 非会員：¥660, IPSJ:学会員：¥330, BIO:会員：¥0, DLIB:会員：¥0 | ||
| Item type | SIG Technical Reports(1) | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 公開日 | 2024-02-29 | |||||||||
| タイトル | ||||||||||
| タイトル | TDbasedUFEを用いた黄色ブドウ球菌敗血症におけるメチシリン耐性の解析 | |||||||||
| タイトル | ||||||||||
| 言語 | en | |||||||||
| タイトル | Analysis of Methicillin Resistance in <i>Staphylococcus Aureus</i> Sepsis Using TDbasedUFE | |||||||||
| 言語 | ||||||||||
| 言語 | jpn | |||||||||
| 資源タイプ | ||||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh | |||||||||
| 資源タイプ | technical report | |||||||||
| 著者所属 | ||||||||||
| 中央大学理工学部物理学科 | ||||||||||
| 著者所属 | ||||||||||
| 中央大学理工学部物理学科 | ||||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||||
| en | ||||||||||
| Department of Physics, Chuo University | ||||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||||
| en | ||||||||||
| Department of Physics, Chuo University | ||||||||||
| 著者名 |
渡邉, 将太郎
× 渡邉, 将太郎
× 田口, 善弘
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| 論文抄録 | ||||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||||
| 内容記述 | scATAC-seq はクロマチンアクセシビリティを細胞の解像度をもって明らかにし，臨床における病理学や病態を理解するうえで重要である．しかしながら scATAC-seq のデータは疎らかつ巨大であるため，それらの多次元的な解析は困難である．TDbasedUFE は複数の条件下で教師なし分類が可能であるため，scATAC-seq の解析に適している．我々は TDbasedUFE を用いて，黄色ブドウ球菌による敗血症患者の末梢血単核細胞（PBMC）の scATAC-seq のデータの分析を行った．本研究では敗血症におけるメチシリン耐性黄色ブドウ球菌（MRSA）とメチシリン感化黄色ブドウ球菌（MSSA）感染の間で，異なる応答を示す遺伝子を細胞の種類ごとに抽出し，その機能を予測した．これらの結果は TDbasedUFE が scATAC-seq のデータの解析に適していることを実証した． | |||||||||
| 書誌レコードID | ||||||||||
| 収録物識別子タイプ | NCID | |||||||||
| 収録物識別子 | AA12055912 | |||||||||
| 書誌情報 |
研究報告バイオ情報学（BIO） 巻 2024-BIO-77, 号 11, p. 1-6, 発行日 2024-02-29 |
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| ISSN | ||||||||||
| 収録物識別子タイプ | ISSN | |||||||||
| 収録物識別子 | 2188-8590 | |||||||||
| Notice | ||||||||||
| SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc. | ||||||||||
| 出版者 | ||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||
| 出版者 | 情報処理学会 | |||||||||
