蛍光顕微鏡画像における深層学習による3次元細胞追跡手法

• Item type: SIG Technical Reports(1)
• 公開日: 2023-12-04
• タイトル: 蛍光顕微鏡画像における深層学習による3次元細胞追跡手法
• タイトル / 言語: en
• タイトル: 3D Cell Tracking by Deep Learning Using Fluorescence Microscope Images
• 言語: jpn
• 資源タイプ / 資源タイプ識別子: http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh
• 資源タイプ: technical report
• 著者所属: 大阪大学大学院情報科学研究科
• 著者所属: 大阪大学大学院情報科学研究科
• 著者所属: 大阪大学大学院情報科学研究科
• 著者所属: 大阪大学大学院医学系研究科／大阪大学大学院生命機能研究科
• 著者所属: 大阪大学大学院医学系研究科／大阪大学大学院生命機能研究科
• 著者所属: 大阪大学大学院医学系研究科／大阪大学大学院生命機能研究科
• 著者所属: 大阪大学大学院情報科学研究科
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Graduate School of Information Science and Technology, Osaka Univerisity
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Graduate School of Information Science and Technology, Osaka Univerisity
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Graduate School of Information Science and Technology, Osaka Univerisity
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Graduate School of Medicine, Osaka University / Graduate School of Frontier Biosciences, Osaka University
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Graduate School of Medicine, Osaka University / Graduate School of Frontier Biosciences, Osaka University
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Graduate School of Medicine, Osaka University / Graduate School of Frontier Biosciences, Osaka University
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Graduate School of Information Science and Technology, Osaka Univerisity
• 著者名: 廣部, 理来; 繁田, 浩功; 瀬尾, 茂人; 芦田, 和馬; 内田, 穣; 石井, 優; 松田, 秀雄
• 著者名(英): Riku, Hirobe; Hironori, Shigeta; Shigeto, Seno; Kazuma, Ashida; Yutaka, Uchida; Masaru, Ishii; Hideo, Matsuda
• 論文抄録 / 内容記述タイプ: Other
• 論文抄録 / 内容記述: 近年のバイオイメージング技術の発達により，生物学や医学において重要な細胞動態の解析に有用な情報となる精密な 3 次元時系列動画像が，蛍光顕微鏡などによって取得可能になってきている．細胞動態を解析するためには，得られた動画像中で解析対象である細胞を継続的に追跡することが必要となる．しかし，3 次元動画像のような情報量の多いデータに対して人力で追跡を行うことは困難であるため，計算機を用いた自動的な 3 次元細胞追跡手法が求められる．一般的な手法では，3 次元データを 2 次元データに投影し，2 次元空間上での細胞追跡を行う手法が多く提案されている．しかし，投影処理を行う場合，深度情報が損失してしまうため，奥行き方向の細胞の重なりを認識できず，そのために細胞の取り違えが発生しうる．そこで本研究では，蛍光顕微鏡によって撮影された細胞の 3 次元動画像を対象に，深層学習を用いて直接3次元空間上での細胞追跡を行う手法を提案する．3 次元空間上での細胞の位置と動きの尤度を 3D U-Net を用いて学習することで 3 次元での細胞追跡を行う．実験の結果，奥行き方向の情報を含めた 3 次元空間上での細胞の追跡を実現できることを確認した．
• 書誌レコードID / 収録物識別子タイプ: NCID
• 書誌レコードID / 収録物識別子: AN10505667
• 書誌情報: 研究報告数理モデル化と問題解決（MPS）; 巻 2023-MPS-146, 号 17, p. 1-6, 発行日 2023-12-04
• ISSN / 収録物識別子タイプ: ISSN
• ISSN / 収録物識別子: 2188-8833
• Notice: SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc.
• 出版者 / 言語: ja
• 出版者: 情報処理学会