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上で選択できる遺伝子データベースの保管方法を何通りか試し，実行時間を計測した．さらに，ボトルネックとなっている hhblits に対してプロファイリングを行い，その結果から並列化数のチューニングやデータベースの保存方法の変更，ソートの最適化を行った．また，AlphaFold の MSA 取得ツール間のデータ依存関係からツール実行を非同期に行うようにした．その結果，TSUBAME3.0 上で単一のアミノ酸配列から立体構造を予測する際の実行時間を平均して 2 分の 1 に短縮することに成功した．","subitem_description_type":"Other"}]},"item_4_biblio_info_10":{"attribute_name":"書誌情報","attribute_value_mlt":[{"bibliographicPageEnd":"8","bibliographic_titles":[{"bibliographic_title":"研究報告数理モデル化と問題解決（MPS）"}],"bibliographicPageStart":"1","bibliographicIssueDates":{"bibliographicIssueDate":"2023-07-17","bibliographicIssueDateType":"Issued"},"bibliographicIssueNumber":"3","bibliographicVolumeNumber":"2023-MPS-144"}]},"relation_version_is_last":true,"weko_creator_id":"44499"},"id":226907,"updated":"2025-01-19T12:20:39.104669+00:00","links":{},"created":"2025-01-19T01:26:13.722729+00:00"}