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アイテム
Cyclic offsetを導入したAlphaFold multimerによる環状ペプチド複合体構造予測
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/226696
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/226696b2d40960-5698-4c23-9380-7b5d6f86ff28
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
|---|---|---|
IPSJ-BIO23074041.pdf (3.2 MB)
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Copyright (c) 2023 by the Information Processing Society of Japan
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| オープンアクセス | ||
| Item type | SIG Technical Reports(1) | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 公開日 | 2023-06-22 | |||||||||||
| タイトル | ||||||||||||
| タイトル | Cyclic offsetを導入したAlphaFold multimerによる環状ペプチド複合体構造予測 | |||||||||||
| 言語 | ||||||||||||
| 言語 | jpn | |||||||||||
| キーワード | ||||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||||
| 主題 | バイオ情報学1 | |||||||||||
| 資源タイプ | ||||||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh | |||||||||||
| 資源タイプ | technical report | |||||||||||
| 著者所属 | ||||||||||||
| 東京工業大学情報理工学院情報工学系 | ||||||||||||
| 著者所属 | ||||||||||||
| 東京工業大学情報理工学院情報工学系 | ||||||||||||
| 著者所属 | ||||||||||||
| 東京工業大学情報理工学院情報工学系 | ||||||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||||||
| en | ||||||||||||
| Department of Computer Science, School of Computing, Tokyo Institute of Technology | ||||||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||||||
| en | ||||||||||||
| Department of Computer Science, School of Computing, Tokyo Institute of Technology | ||||||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||||||
| en | ||||||||||||
| Department of Computer Science, School of Computing, Tokyo Institute of Technology | ||||||||||||
| 著者名 |
冨樫, 慧乃辰
× 冨樫, 慧乃辰
× 小杉, 孝嗣
× 大上, 雅史
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| 論文抄録 | ||||||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||||||
| 内容記述 | 環状ペプチドは低分子や高分子の利点を併せ持つ新しい分子として注目を集めており，タンパク質間相互作用阻害をはじめとする様々な作用機序を持つ医薬品が開発されている．また，実験技術の向上によって活性が明らかな環状ペプチドと標的タンパク質の情報も増えてきた．一方で，実験による複合体の立体構造の解析は，コストや技術的な問題であまり進んでおらず，環状ペプチドの合理的医薬品設計に向けて計算機による複合体構造予測手法の開発が促されている．環状ペプチド複合体に関しては既存のデータベースも存在しないため，本研究ではまず環状ペプチド複合体構造データセットの構築を行った．そして，cyclic offsetを導入したAlphaFold Multimerによる環状ペプチド複合体構造予測を行い，AutoDock CrankPepなど他の複合体予測手法と性能を比較し，環構造のタイプや構成アミノ酸の種類，残基数などの観点から予測精度に関する傾向を分析した． | |||||||||||
| 書誌レコードID | ||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | NCID | |||||||||||
| 収録物識別子 | AA12055912 | |||||||||||
| 書誌情報 |
研究報告バイオ情報学（BIO） 巻 2023-BIO-74, 号 41, p. 1-6, 発行日 2023-06-22 |
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| ISSN | ||||||||||||
| 収録物識別子タイプ | ISSN | |||||||||||
| 収録物識別子 | 2188-8590 | |||||||||||
| Notice | ||||||||||||
| SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc. | ||||||||||||
| 出版者 | ||||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||||
| 出版者 | 情報処理学会 | |||||||||||
