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  1. 研究報告
  2. 数理モデル化と問題解決(MPS)
  3. 2023
  4. 2023-MPS-143

フラグメントリンキング法に基づくタンパク質分解誘導キメラ分子のリンカー設計

https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/226510
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/226510
f86b99a4-0b75-4a4b-bce7-cf0a216bb702
名前 / ファイル ライセンス アクション
IPSJ-MPS23143042.pdf IPSJ-MPS23143042.pdf (1.2 MB)
Copyright (c) 2023 by the Information Processing Society of Japan
オープンアクセス
Item type SIG Technical Reports(1)
公開日 2023-06-22
タイトル
タイトル フラグメントリンキング法に基づくタンパク質分解誘導キメラ分子のリンカー設計
言語
言語 jpn
キーワード
主題Scheme Other
主題 バイオ情報学1
資源タイプ
資源タイプ識別子 http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh
資源タイプ technical report
著者所属
東京工業大学情報理工学院情報工学系
著者所属
東京工業大学情報理工学院情報工学系
著者所属(英)
en
Department of Computer Science, School of Computing, Tokyo Institute of Technology
著者所属(英)
en
Department of Computer Science, School of Computing, Tokyo Institute of Technology
著者名 石沢, 涼太

× 石沢, 涼太

石沢, 涼太

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大上, 雅史

× 大上, 雅史

大上, 雅史

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論文抄録
内容記述タイプ Other
内容記述 ユビキチン・プロテアソーム分解を誘導して標的タンパク質を分解するタンパク質分解誘導キメラ分子(PROTAC)は,従来の分子標的薬では標的とできなかったタンパク質を狙える新しいモダリティである.PROTAC は標的のタンパク質とE3リガーゼそれぞれに結合するリガンドと,それらのリガンドをつなげるリンカーから構成されており,リンカーの長さや組成によって PROTAC の物性や標的特異性に影響を与えることがわかっている.しかし,最適なリンカーを設計する方法は確立されておらず,リンカー設計のための計算技術開発が期待されている.本研究では,2 つのフラグメントをつなぐリンカーを生成するフラグメントリンキング法を応用し,PROTAC のリンカー生成を行った.生成されたリンカーの性能を評価するため,タンパク質,E3 リガーゼ,PROTAC のコンフォメーションのモデリングを行い,単純なリンカーとの比較検証を行った.
書誌レコードID
収録物識別子タイプ NCID
収録物識別子 AN10505667
書誌情報 研究報告数理モデル化と問題解決(MPS)

巻 2023-MPS-143, 号 42, p. 1-6, 発行日 2023-06-22
ISSN
収録物識別子タイプ ISSN
収録物識別子 2188-8833
Notice
SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc.
出版者
言語 ja
出版者 情報処理学会
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Ver.1 2025-01-19 12:27:14.570420
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