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  1. 研究報告
  2. 数理モデル化と問題解決(MPS)
  3. 2022
  4. 2022-MPS-138

野生ヒラメの血縁推定における尤度比のパーミュテーション検定

https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/218626
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/218626
7291c08e-b47d-40b8-bbe7-31d3a2539400
名前 / ファイル ライセンス アクション
IPSJ-MPS22138056.pdf IPSJ-MPS22138056.pdf (3.3 MB)
Copyright (c) 2022 by the Information Processing Society of Japan
オープンアクセス
Item type SIG Technical Reports(1)
公開日 2022-06-20
タイトル
タイトル 野生ヒラメの血縁推定における尤度比のパーミュテーション検定
言語
言語 jpn
資源タイプ
資源タイプ識別子 http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh
資源タイプ technical report
著者所属
東北大学大学院情報科学研究科
著者所属
東北大学大学院農学研究科
著者所属
東北大学大学院農学研究科
著者名 大林, 武

× 大林, 武

大林, 武

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安藤, 大樹

× 安藤, 大樹

安藤, 大樹

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池田, 実

× 池田, 実

池田, 実

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論文抄録
内容記述タイプ Other
内容記述 水産業は豊かな食文化の基盤であり,また地域経済を支える産業としても重要である.しかし漁獲対象種の資源量は減少傾向にあるため,漁業資源を適切に管理していくことが持続的な水産業には欠かせない.栽培漁業は人工繁殖させた稚魚を放流することで資源量を維持・増加させる方法である.例えばヒラメは,宮城県をはじめ日本各地で栽培漁業が行われており,年間の放流量は約 2000 万尾にのぼる.一方,栽培漁業では遺伝的多様性のレベルが低下した稚魚を大量に自然界に放流するため,対象魚種の遺伝的多様性を減少させてしまう懸念も指摘されている.野生集団の血縁度を正確に推定し,その年次変化を捉えることができれば,栽培漁業の適切な運用をデータから支えることができる.そこで本研究では,マイクロサテライト DNA プロファイリング法に基づくヒラメの野生集団の血縁推定において,偽陽性をコントロールする方法を検討した.一般にある個体ペアの DNA プロファイルが特定の血縁関係を支持するかは尤度比で評価できる.しかし,野生集団における血縁は一般に薄いため,偽陽性の扱いが問題になる.本研究では DNA プロファイルのパーミュテーションにより尤度比が評価できることを示す.
書誌レコードID
収録物識別子タイプ NCID
収録物識別子 AN10505667
書誌情報 研究報告数理モデル化と問題解決(MPS)

巻 2022-MPS-138, 号 56, p. 1-7, 発行日 2022-06-20
ISSN
収録物識別子タイプ ISSN
収録物識別子 2188-8833
Notice
SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc.
出版者
言語 ja
出版者 情報処理学会
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Ver.1 2025-01-19 15:06:11.861666
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