WEKO3
アイテム
Attention機構ベースの深層学習によるヒト-ウイルスタンパク質間相互作用予測手法の提案
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/216929
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/2169294db656dd-8548-43d2-a948-14dd961f3488
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
|---|---|---|
IPSJ-BIO22069019.pdf (1.6 MB)
|
Copyright (c) 2022 by the Information Processing Society of Japan
|
|
| オープンアクセス | ||
| Item type | SIG Technical Reports(1) | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 公開日 | 2022-03-03 | |||||||||
| タイトル | ||||||||||
| タイトル | Attention機構ベースの深層学習によるヒト-ウイルスタンパク質間相互作用予測手法の提案 | |||||||||
| 言語 | ||||||||||
| 言語 | jpn | |||||||||
| 資源タイプ | ||||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh | |||||||||
| 資源タイプ | technical report | |||||||||
| 著者所属 | ||||||||||
| 九州工業大学 | ||||||||||
| 著者所属 | ||||||||||
| 九州工業大学 | ||||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||||
| en | ||||||||||
| Kyushu Institute of Technology | ||||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||||
| en | ||||||||||
| Kyushu Institute of Technology | ||||||||||
| 著者名 |
築山, 翔
× 築山, 翔
× 倉田, 博之
|
|||||||||
| 論文抄録 | ||||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||||
| 内容記述 | 現在のSARS-CoV-2の感染状況からもわかるように、ウイルスは出現から急速に感染が拡大する。ウイルスは細胞に侵入し、宿主の機能を利用することで、自身の複製を増殖させる。それらのプロセスにおいて、ヒト-ウイルスタンパク質間の相互作用(human-virus protein-protein interaction; HV-PPI)は重要な役割を担う。そのため、ウイルスの感染メカニズムの理解と抗ウイルス薬の開発において、HV-PPIを特定することは重要である。本研究では、文脈情報を表現するための手法であるword2vecを利用したアミノ酸配列の符号化に加えて、Interactive proteome-based encoding method (IPEM)と名付けた新しい符号化手法を提案した。この方法では、PPIネットワークとマルチプルアライメントを用いることで、予測対象となるタンパク質と相互作用するタンパク質の配列情報を符号化する。さらに、注意機構とCNNに基づくニューラルネットワークを構築し、HV-PPIの予測を行った。その結果、我々のモデルは最先端の手法よりも高い精度でHV-PPIを予測した。 | |||||||||
| 書誌レコードID | ||||||||||
| 収録物識別子タイプ | NCID | |||||||||
| 収録物識別子 | AA12055912 | |||||||||
| 書誌情報 |
研究報告バイオ情報学（BIO） 巻 2022-BIO-69, 号 19, p. 1-6, 発行日 2022-03-03 |
|||||||||
| ISSN | ||||||||||
| 収録物識別子タイプ | ISSN | |||||||||
| 収録物識別子 | 2188-8590 | |||||||||
| Notice | ||||||||||
| SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc. | ||||||||||
| 出版者 | ||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||
| 出版者 | 情報処理学会 | |||||||||
