Elementary flux mode型経路の化学量論的な代謝ネットワーク構造variantの対称性の数

• Item type: SIG Technical Reports(1)
• 公開日: 2021-11-23
• タイトル: Elementary flux mode型経路の化学量論的な代謝ネットワーク構造variantの対称性の数
• タイトル / 言語: en
• タイトル: Number of symmetries of stoichiometric metabolic network structure variant of elementary flux mode type pathway
• 言語: jpn
• 資源タイプ / 資源タイプ識別子: http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh
• 資源タイプ: technical report
• 著者所属: 岡山大学学術研究院医歯薬学域（医）生化学分野
• 著者名: 太田, 潤
• 著者名(英): Jun, Ohta
• 論文抄録 / 内容記述タイプ: Other
• 論文抄録 / 内容記述: 代謝ネットワークにおける “経路” として，化学量論的に釣り合った個々の反応の集合としての “経路” である elementary flux mode 型経路（EFM 型経路）を考えることができる．EFM 型経路に対して可能な化学量論的に釣り合った代謝産物レベルネットワーク構造（化学量論的な代謝ネットワーク構造）のそれぞれを EFM 型経路の variant と呼ぶ．EFM 型経路の unique な variant は，存在可能な 1 つの variant に対する置換として算出される構造の異同判定により得られる．ペントースリン酸経路の非還元的な反応による 2n 分子の fructose 6-phosphate と n 分子の glyceraldehyde 3-phosphate からの 3n 分子の ribose 5-phosphate 生成は 5 反応（延べ 7n 反応）からなる EFM 型経路である．この EFM 型経路の unique な variant それぞれについて対応する置換の数と対称性の数を，4 以下の自然数nに対して調べた．それぞれの n の EFM 型経路に unique な variant が 2 つ以上存在した．variant の対称性の数の最小値が何れの n についても 1 である一方，最大値は n が大きいほど大きな値を示した．それぞれの unique な variant の置換の数と対称性の数の積は n の値（EFM 型経路）ごとに一定であった．
• 書誌レコードID / 収録物識別子タイプ: NCID
• 書誌レコードID / 収録物識別子: AA12055912
• 書誌情報: 研究報告バイオ情報学（BIO）; 巻 2021-BIO-68, 号 4, p. 1-3, 発行日 2021-11-23
• ISSN / 収録物識別子タイプ: ISSN
• ISSN / 収録物識別子: 2188-8590
• Notice: SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc.
• 出版者 / 言語: ja
• 出版者: 情報処理学会