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テンソル分解に基づく教師なし学習による変数選択のRNAi処理を行ったプラナリアのRNA-seq解析への適用
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/205751
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/2057511e0dbf45-aab9-4a8f-abb3-45e83d5f9631
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
|---|---|---|
IPSJ-BIO20062001.pdf (966.7 kB)
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Copyright (c) 2020 by the Information Processing Society of Japan
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| オープンアクセス | ||
| Item type | SIG Technical Reports(1) | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 公開日 | 2020-06-22 | |||||||||
| タイトル | ||||||||||
| タイトル | テンソル分解に基づく教師なし学習による変数選択のRNAi処理を行ったプラナリアのRNA-seq解析への適用 | |||||||||
| 言語 | ||||||||||
| 言語 | jpn | |||||||||
| キーワード | ||||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||||
| 主題 | BIO | |||||||||
| 資源タイプ | ||||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh | |||||||||
| 資源タイプ | technical report | |||||||||
| 著者所属 | ||||||||||
| 中央大学 | ||||||||||
| 著者所属 | ||||||||||
| 青山学院大学 | ||||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||||
| en | ||||||||||
| Chuo University | ||||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||||
| en | ||||||||||
| Aoyama Gakuin University | ||||||||||
| 著者名 |
田口, 善弘
× 田口, 善弘
× 鹿島, 誠
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| 論文抄録 | ||||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||||
| 内容記述 | プラナリアは驚異的な自己再生能力を有していることで有名な生命体であるが，どのような分子生物学的な基盤がこのような特異な自己再生能力を担保しているかはよく解っていない．近年の研究によりキー遺伝子が解明され，特定の遺伝子をノックダウンすることで，リーサルではない範囲で自己再生能力特異的な表現型変異が起こせることが解ってきた．本研究ではこれらのキー遺伝子を RNAi で抑止して自己再生の力を奪った場合の時系列的な RNA-seq を敢行して，キー遺伝子のノックアウトでどのような遺伝子が影響を受けるかの観測を行った．RNA-seq のデータセットに「テンソル分解を用いた教師なし学習による変数選択」法を用いることで，RNAi 特異的でかつ時系列依存的に発現が変化する転写物群の特定に成功したのでこれについて報告する． | |||||||||
| 書誌レコードID | ||||||||||
| 収録物識別子タイプ | NCID | |||||||||
| 収録物識別子 | AA12055912 | |||||||||
| 書誌情報 |
研究報告バイオ情報学（BIO） 巻 2020-BIO-62, 号 1, p. 1-4, 発行日 2020-06-22 |
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| ISSN | ||||||||||
| 収録物識別子タイプ | ISSN | |||||||||
| 収録物識別子 | 2188-8590 | |||||||||
| Notice | ||||||||||
| SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc. | ||||||||||
| 出版者 | ||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||
| 出版者 | 情報処理学会 | |||||||||
