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アイテム
代謝ネットワークにおけるelementary flux mode型経路の完全原子レベルマッピング
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/199083
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/199083c8fa4bea-c746-41ac-aa3e-fef0ff3104dd
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
|---|---|---|
IPSJ-BIO19059002.pdf (1.3 MB)
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Copyright (c) 2019 by the Information Processing Society of Japan
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| オープンアクセス | ||
| Item type | SIG Technical Reports(1) | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 公開日 | 2019-09-01 | |||||||
| タイトル | ||||||||
| タイトル | 代謝ネットワークにおけるelementary flux mode型経路の完全原子レベルマッピング | |||||||
| タイトル | ||||||||
| 言語 | en | |||||||
| タイトル | Complete atomic-level mapping of elementary flux mode type pathways in metabolic networks | |||||||
| 言語 | ||||||||
| 言語 | jpn | |||||||
| 資源タイプ | ||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh | |||||||
| 資源タイプ | technical report | |||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 岡山大学大学院医歯薬学総合研究科（医）生化学分野 | ||||||||
| 著者名 |
太田, 潤
× 太田, 潤
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| 著者名(英) |
Jun, Ohta
× Jun, Ohta
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| 論文抄録 | ||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||
| 内容記述 | 代謝ネットワークにおいて “経路” と呼ばれるものには in silico atomic tracing により基質‐生成物の二項関係を連ねて原料分子を目的分子につないだタイプの “経路” と化学量論的に釣り合った個々の反応の集合としての “経路” とがある．前者の “経路” は原子レベルの情報を含むが目的分子構造の部分構造の生成の道筋であり目的分子構造全体の生成の道筋でない場合があり得る．後者の “経路” は目的分子構造全体の生成の道筋であるが原子レベルの情報を含まない．本稿では，後者の “経路” をelementary flux mode 型経路 （EFM型経路） と呼ぶ．原理的に EFM 型経路では原料分子のすべての原子と目的分子のすべての原子が一対一に対応している筈である．前回の研究報告において目的分子の分子構造全体の生成経路を isotopomer tracing または EMU tracing に引き続き原子レベルで計算する方法を述べた．この方法を発展させ EFM 型経路に原子レベルの情報を与えるための基本的なアルゴリズムを開発したので報告する． | |||||||
| 書誌レコードID | ||||||||
| 収録物識別子タイプ | NCID | |||||||
| 収録物識別子 | AA12055912 | |||||||
| 書誌情報 |
研究報告バイオ情報学（BIO） 巻 2019-BIO-59, 号 2, p. 1-6, 発行日 2019-09-01 |
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| ISSN | ||||||||
| 収録物識別子タイプ | ISSN | |||||||
| 収録物識別子 | 2188-8590 | |||||||
| Notice | ||||||||
| SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc. | ||||||||
| 出版者 | ||||||||
| 言語 | ja | |||||||
| 出版者 | 情報処理学会 | |||||||
