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  1. 研究報告
  2. バイオ情報学(BIO)
  3. 2019
  4. 2019-BIO-58

代謝ネットワークにおける原子レベル完全生合成経路の算出

https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/197661
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/197661
793b9cc5-028e-4fdb-a91a-131e80e690c7
名前 / ファイル ライセンス アクション
IPSJ-BIO19058059.pdf IPSJ-BIO19058059.pdf (1.2 MB)
Copyright (c) 2019 by the Information Processing Society of Japan
オープンアクセス
Item type SIG Technical Reports(1)
公開日 2019-06-10
タイトル
タイトル 代謝ネットワークにおける原子レベル完全生合成経路の算出
タイトル
言語 en
タイトル Computation of atomic-level pathways for complete biosynthesis in metabolic networks
言語
言語 jpn
資源タイプ
資源タイプ識別子 http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh
資源タイプ technical report
著者所属
岡山大学大学院医歯薬学総合研究科(医)生化学分野
著者名 太田, 潤

× 太田, 潤

太田, 潤

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著者名(英) Jun, Ohta

× Jun, Ohta

en Jun, Ohta

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論文抄録
内容記述タイプ Other
内容記述 代謝ネットワークにおける特定の代謝産物の生成に必要な最小限の原料代謝産物を算出する試みや,代謝産物レベルの完全生合成経路すべてを算出する方法が報告されてきた.これらは原子レベルの情報を全く用いない.それに対して,私は,原子レベルの情報を用い特定の代謝産物のみを原料として完全合成され得る代謝産物を求める手法として,isotopomer tracing (代謝ネットワークにおいて原料isotopomerから生成し得る生成物isotopomerを列挙する),EMU tracing (代謝ネットワークにおいて原料elementary metabolite unit (EMU)から生成し得る生成物EMUを列挙する)を報告してきた.本稿では,isotopomer tracingとEMU tracingを発展させることにより得られた,原料代謝産物からの生成物完全生合成経路の算出手法を報告する.この経路算出手法は基本性能として原子レベルの情報を含む完全生合成経路を算出する.
書誌レコードID
収録物識別子タイプ NCID
収録物識別子 AA12055912
書誌情報 研究報告バイオ情報学(BIO)

巻 2019-BIO-58, 号 59, p. 1-6, 発行日 2019-06-10
ISSN
収録物識別子タイプ ISSN
収録物識別子 2188-8590
Notice
SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc.
出版者
言語 ja
出版者 情報処理学会
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Ver.1 2025-01-19 22:15:45.827270
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