Item type |
SIG Technical Reports(1) |
公開日 |
2019-03-01 |
タイトル |
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タイトル |
SELEX法を用いた核酸アプタマー推定のための高速クラスタリング手法とその性能評価 |
タイトル |
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言語 |
en |
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タイトル |
A Fast Clustering Method for Aptamer Estimation Using SELEX Sequence Data and Its Performance Evaluation |
言語 |
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言語 |
jpn |
資源タイプ |
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資源タイプ識別子 |
http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh |
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資源タイプ |
technical report |
著者所属 |
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東北大学大学院情報科学研究科 |
著者所属 |
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NECソリューションイノベータ株式会社/東北大学大学院情報科学研究科 |
著者所属 |
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東北大学大学院情報科学研究科 |
著者所属 |
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NECソリューションイノベータ株式会社 |
著者所属 |
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NECソリューションイノベータ株式会社 |
著者所属 |
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NECソリューションイノベータ株式会社 |
著者所属 |
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NECソリューションイノベータ株式会社 |
著者所属 |
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東北大学大学院情報科学研究科 |
著者名 |
小野, 貴義
加藤, 信太郎
伊藤, 康一
皆川, 宏貴
堀井, 克紀
白鳥, 行大
和賀, 巌
青木, 孝文
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論文抄録 |
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内容記述タイプ |
Other |
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内容記述 |
標的分子と特異的に結合する核酸分子(アプタマー)は,Systematic Evolution of Ligands by EXponential enrichment (SELEX)法により選択される.SELEX法とは,ランダムに初期化された核酸ライブラリーから標的分子による選択とPolymerase Chain Reaction (PCR)による増幅を繰り返す実験手法である.SELEX法から得られた核酸ライブラリーを次世代ゲノムシーケンサーで読み取り,大量のアプタマー候補の塩基配列を得る.候補配列すべてを実験的に評価することは現実的ではないため,至適配列を効率的に選択する必要がある.本稿では,大量の候補配列をクラスター化し,その代表配列をアプタマーの至適配列とするための高速なクラスタリング手法を提案する.性能評価実験を通して,速度と精度における提案手法の有効性を示す. |
書誌レコードID |
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収録物識別子タイプ |
NCID |
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収録物識別子 |
AA12055912 |
書誌情報 |
研究報告バイオ情報学(BIO)
巻 2019-BIO-57,
号 7,
p. 1-6,
発行日 2019-03-01
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ISSN |
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収録物識別子タイプ |
ISSN |
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収録物識別子 |
2188-8590 |
Notice |
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SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc. |
出版者 |
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言語 |
ja |
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出版者 |
情報処理学会 |