WEKO3
アイテム
機械学習を用いたホモロジーモデリングのための配列アライメント手法
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/194992
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/19499225cc76d2-639d-4431-b15a-9e8e9f993f56
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
|---|---|---|
IPSJ-BIO19057005.pdf (4.0 MB)
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Copyright (c) 2019 by the Information Processing Society of Japan
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| オープンアクセス | ||
| Item type | SIG Technical Reports(1) | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 公開日 | 2019-03-01 | |||||||||
| タイトル | ||||||||||
| タイトル | 機械学習を用いたホモロジーモデリングのための配列アライメント手法 | |||||||||
| タイトル | ||||||||||
| 言語 | en | |||||||||
| タイトル | Sequence alignment method based on <i>k</i>-Nearest Neighbor for improving homology modeling | |||||||||
| 言語 | ||||||||||
| 言語 | jpn | |||||||||
| 資源タイプ | ||||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh | |||||||||
| 資源タイプ | technical report | |||||||||
| 著者所属 | ||||||||||
| 東京工業大学情報理工学院 | ||||||||||
| 著者所属 | ||||||||||
| 東京工業大学情報理工学院 | ||||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||||
| en | ||||||||||
| School of Computing, Tokyo Institute of Technology | ||||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||||
| en | ||||||||||
| School of Computing, Tokyo Institute of Technology | ||||||||||
| 著者名 |
牧垣, 秀一朗
× 牧垣, 秀一朗
× 石田, 貴士
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| 論文抄録 | ||||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||||
| 内容記述 | ホモロジーモデリングは相同性のある構造既知のタンパク質を鋳型に用いてアミノ酸配列からタンパク質の構造を予測する手法であり，鋳型となるタンパク質が発見できれば機能予測や薬剤開発でも使えるレベルの予測精度を達成できる手法である．しかし，構造未知のアミノ酸配列と既知の配列とのアライメントが最終的な予測結果の精度に大きく影響することが知られている．本研究では，アライメント生成時に用いるアミノ酸置換スコアを機械学習を用いた予測値に置き換えることで，より構造予測精度が向上するアライメントを生成する手法を示す．また，既存の相同性検索手法から得られるアライメントを用いた予測構造と比較して精度が向上することを確認した． | |||||||||
| 書誌レコードID | ||||||||||
| 収録物識別子タイプ | NCID | |||||||||
| 収録物識別子 | AA12055912 | |||||||||
| 書誌情報 |
研究報告バイオ情報学（BIO） 巻 2019-BIO-57, 号 5, p. 1-8, 発行日 2019-03-01 |
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| ISSN | ||||||||||
| 収録物識別子タイプ | ISSN | |||||||||
| 収録物識別子 | 2188-8590 | |||||||||
| Notice | ||||||||||
| SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc. | ||||||||||
| 出版者 | ||||||||||
| 言語 | ja | |||||||||
| 出版者 | 情報処理学会 | |||||||||
