電子顕微鏡画像における薬剤耐性菌株の識別と形態的特徴の比較

• Item type: SIG Technical Reports(1)
• 公開日: 2019-01-10
• タイトル: 電子顕微鏡画像における薬剤耐性菌株の識別と形態的特徴の比較
• タイトル / 言語: en
• タイトル: Classification of Microscopy Images of Drug-Resistant Strains and Comparison of Their Morphological Features
• 言語: jpn
• 資源タイプ / 資源タイプ識別子: http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh
• 資源タイプ: technical report
• 著者所属: 大阪大学産業科学研究所
• 著者所属: 大阪大学産業科学研究所
• 著者所属: 大阪大学産業科学研究所
• 著者所属: 大阪大学産業科学研究所
• 著者所属: 大阪大学蛋白質研究所／筑波大学生存ダイナミクス研究センター
• 著者所属: 大阪大学蛋白質研究所
• 著者所属: 理化学研究所／東京大学
• 著者所属: 大阪大学産業科学研究所
• 著者所属: 大阪電気通信大学
• 著者所属: 大阪大学産業科学研究所
• 著者所属: 大阪大学産業科学研究所
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Institute of Scientific and Industrial Research, Osaka University
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Institute of Scientific and Industrial Research, Osaka University
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Institute of Scientific and Industrial Research, Osaka University
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Institute of Scientific and Industrial Research, Osaka University
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Institute for Protein Research, Osaka University / University of Tsukuba TARA Center Life Science Center for Survival Dynamics, Tsukuba Advanced Research Alliance
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Institute for Protein Research, Osaka University
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): RIKEN, Center for Biosystems Dynamics Research / Universal Biology Institute, The University of Tokyo
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Institute of Scientific and Industrial Research, Osaka University
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Osaka Electoro-Communication University
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Institute of Scientific and Industrial Research, Osaka University
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Institute of Scientific and Industrial Research, Osaka University
• 著者名: 長野, 章宏; 青木, 工太; 西野, 美都子; 福島, 愛子; 岩崎, 憲治; 廣瀬, 未果; 古澤, 力; グルシニコフ, アンドレイ; 越後, 富夫; 西野, 邦彦; 八木, 康史
• 著者名(英): Akihiro, Nagano; Kota, Aoki; Mitsuko, Hayashi-Nishino; Aiko, Fukushima; Kenji, Iwasaki; Mika, Hirose; Chikara, Furusawa; Andrey, Grushnikov; Tomio, Echigo; Kunihiko, Nishino; Yasushi, Yagi
• 論文抄録 / 内容記述タイプ: Other
• 論文抄録 / 内容記述: 近年，複数の抗菌薬への耐性を持つ病原菌 （多剤耐性菌） が出現し，世界的な問題となっている．耐性菌に関する様々な研究が行われる中，細菌が耐性を獲得する過程で形態が変化することが明らかとなってきた．どのような遺伝子の変化により細菌の形態が変化するかは生物学的に興味深い問題であるが，いまだに解明されていない．形態変化と遺伝子の関係を解明するためには，細菌株の形態の違いを定量的に評価する必要がある．本稿では，細菌株の形態の違いを識別する課題に取り組み，識別結果を解析することで各株間の相違点を明らかにする．各株間の形態学的な特徴は，外膜の形状や細菌内の異染小体 （顆粒） の有無等に表れているが，外膜部分の像が不明瞭なものも多く，細菌の輪郭を抽出することは難しい．また，試料作製における固定や染色の影響により，同じ株の細菌であっても見え方が大きく異なる場合がある．そこで，電子顕微鏡画像データのばらつきに頑健な畳み込みニューラルネットワーク (CNN) を提案する．また GradCAM を用いた CNN の注目領域の可視化から，細菌株ごとに形態的特徴を分析する．
• 書誌レコードID / 収録物識別子タイプ: NCID
• 書誌レコードID / 収録物識別子: AA11131797
• 書誌情報: 研究報告コンピュータビジョンとイメージメディア（CVIM）; 巻 2019-CVIM-215, 号 32, p. 1-8, 発行日 2019-01-10
• ISSN / 収録物識別子タイプ: ISSN
• ISSN / 収録物識別子: 2188-8701
• Notice: SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc.
• 出版者 / 言語: ja
• 出版者: 情報処理学会