@techreport{oai:ipsj.ixsq.nii.ac.jp:00178083,
 author = {桑村, 慎哉 and 風間, 哲 and 吉田, 英司 and 小川, 淳二 and 三吉, 貴史 and 野口, 泰生 and Shinya, Kuwamura and Satoshi, Kazama and Eiji, Yoshida and Junji, Ogawa and Takashi, Miyoshi and Yasuo, Noguchi},
 issue = {8},
 month = {Mar},
 note = {データ移動コストを削減してシステムを高速化するため，メモリの近傍で演算を行うデータ近傍演算が最近注目されている．今回，我々はソフトウェア制御型 SSD のコントローラに演算回路を実装し，ゲノム解析分野における遺伝子変異データベースの集約処理に適用した．提案方式は，従来の SSD からデータを読み出して CPU で処理する方式よりも 1.4 倍高速であることが分かった．さらに，SSD 3 台では，全データを主記憶上に展開しておくインメモリ方式よりも高速化できる可能性を示した．, Recently, a sort of near-data processing is a hot topic, in order to reduce data transfer cost and get higher system performances. We implemented multiple processing units in a software-controlled PCIe card SSD to aggregate gene variants in a genome analysis database. Our proposed method achieves 1.4 times faster than that of conventional methods, which basically fetch data from a SSD database to main memory and process genome anal ysis with multiple CPU. Consequently, to use three PCIe card SSDs has a possibility to overcome even in-memory processing performance, with which all data is prepared in main memory.},
 title = {ソフトウェア制御型SSDを用いたゲノム解析向けデータ近傍演算の高速化\n},
 year = {2017}
}