多次元分布の線形基底変換による圧縮表現の提案 及びタンパク質残基間相対位置分布への応用

• Item type: Trans(1)
• 公開日: 1999-02-15
• タイトル: 多次元分布の線形基底変換による圧縮表現の提案 及びタンパク質残基間相対位置分布への応用
• タイトル / 言語: en
• タイトル: A compressed representation of multiple-dimensional distribution by linear base-transformation, and its application to the residue-pair relative distribution of proteins
• 言語: jpn
• キーワード / 主題Scheme: Other
• キーワード / 主題: オリジナル論文
• 資源タイプ / 資源タイプ識別子: http://purl.org/coar/resource_type/c_6501
• 資源タイプ: journal article
• 著者所属: 技術研究組合新情報処理開発機構
• 著者所属: 技術研究組合新情報処理開発機構
• 著者所属: 技術研究組合新情報処理開発機構
• 著者所属: 技術研究組合新情報処理開発機構
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Real World Computing Partnership
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Real World Computing Partnership
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Real World Computing Partnership
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Real World Computing Partnership
• 著者名: 鬼塚健太郎; 野口, 保; 安藤, 誠; 秋山, 泰
• 著者名(英): Kentaro, Onizuka; Tamotsu, Noguchi; Makoto, Ando; Yutaka, Akiyama
• 論文抄録 / 内容記述タイプ: Other
• 論文抄録 / 内容記述: 多次元での分布を線形基底変換し さらに変換パラメータ数を大幅に減らすことで 多次元分布を少数のパラメータによって正確に記述する方法を提案する. ついで この手法をタンパク質の同一鎖に含まれる二つの残基の相対位置の分布を表現することに応用し それを用いてタンパク質立体構造からの残基配列推定問題を解き 多次元分布表現法の有効性を検証する. まず 隣接する残基間の相対位置を ほぼ完全に記述する3つの二面角(φ^d ψ^d ω^d)の三自由度分布に適用する. ついで 隣接しない残基間の相対位置を表す極座標と相対姿勢を表すオイラー角(θ^e φ^e ψ^e)の合計六自由度(r^P θ^P φ^P θ^e φ^e ψ^e)の分布に適用する.
• 論文抄録(英) / 内容記述タイプ: Other
• 論文抄録(英) / 内容記述: We propose a representation method to strongly reduce the parameters representing a multiple-dimensional distribution. The method reduces the number of parameters by linearly expanding the distribution with orthonormal linear bases. To evaluate the represetation power of the method, we apply it to the distribution of the relative position of amino-acid-residue pairs in a protein chain. We firstly apply this method to represent the distribution of three dihedral angels (φ^d,ψ^d,ω^d) which almost perfectly represent the relative position of adjacent residues, and then apply it to the distribution of the relative position of residue paris in the sequence, where the relative position is represented by six parameters (r^P,θ^P,φ^P,θ^e,φ^e,ψ^e) three of which are polar coordinates (r^p, θ^P, φ^P) and the other three are Euler's angles (θ^e, φ^e,ψ^e) .
• 書誌レコードID / 収録物識別子タイプ: NCID
• 書誌レコードID / 収録物識別子: AA11464803
• 書誌情報: 情報処理学会論文誌数理モデル化と応用（TOM）; 巻 40, 号 SIG02(TOM1), p. 105-116, 発行日 1999-02-15
• ISSN / 収録物識別子タイプ: ISSN
• ISSN / 収録物識別子: 1882-7780
• 出版者 / 言語: ja
• 出版者: 情報処理学会