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生体分子間相互作用と局在に関する空間シミュレーションモデル
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/17096
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/1709688e56ab0-d41e-4e02-b1fc-d041857d7b01
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
|---|---|---|
IPSJ-TOM4815003.pdf (836.2 kB)
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Copyright (c) 2007 by the Information Processing Society of Japan
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| オープンアクセス | ||
| Item type | Trans(1) | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 公開日 | 2007-10-15 | |||||||
| タイトル | ||||||||
| タイトル | 生体分子間相互作用と局在に関する空間シミュレーションモデル | |||||||
| タイトル | ||||||||
| 言語 | en | |||||||
| タイトル | Simulation Model for Interactions and Localization of Biological Molecules | |||||||
| 言語 | ||||||||
| 言語 | jpn | |||||||
| キーワード | ||||||||
| 主題Scheme | Other | |||||||
| 主題 | オリジナル論文 | |||||||
| 資源タイプ | ||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_6501 | |||||||
| 資源タイプ | journal article | |||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 理化学研究所ゲノム科学総合研究センター | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 千葉大学大学院薬学研究院 | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 北陸先端科学技術大学院大学知識科学研究科 | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 理化学研究所ゲノム科学総合研究センター | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| RIKEN Genomic Sciences Center | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Graduate School of Pharmaceutical Sciences, Chiba University | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| School of Knowledge Science, Japan Advanced Institute of Science and Technology | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| RIKEN Genomic Sciences Center | ||||||||
| 著者名 |
我妻竜三
小林, 弘
山本, 知幸
小長谷, 明彦
× 我妻竜三 小林, 弘 山本, 知幸 小長谷, 明彦
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| 著者名(英) |
Ryuzo, AZUMA
Hiroshi, KOBAYASHI
Tomoyuki, YAMAMOTO
Akihiko, KONAGAYA
× Ryuzo, AZUMA Hiroshi, KOBAYASHI Tomoyuki, YAMAMOTO Akihiko, KONAGAYA
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| 論文抄録 | ||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||
| 内容記述 | 分子イメージング技術の進歩によって細胞内における時空間の分子運動を視覚化することができるようになった．しかしながら，観察された分子レベルの運動がどのようなメカニズムの帰結として生じているのかについての説明はこれまでのところ推測の域を出ていないようである．我々は細胞における分子運動，相互作用，局在，などの理論解析のための，三次元空間内における粒子の反応拡散シミュレーションアルゴリズムを提案する．細胞表面における分子間相互作用のシミュレーションを行うことにより，クラスタリングドメイン（約 0.2 um）の生成を見い出した．このドメインを構成する分子の軌跡は「ホップ拡散」を再現する．これらの結果は，局在を理論的に解析するために，我々のアプローチが有望であることを示している． | |||||||
| 論文抄録(英) | ||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||
| 内容記述 | Spatio-temporal dynamics within cells can now be visualized at appropriate resolution, due to the advances in molecular imaging technologies. However, little is known concerning how molecular-level dynamics affect properties at the cellular level. We propose an algorithm designed for three-dimensional simulation of the reaction-diffusion dynamics of molecules, based on a particle model. Snapshot images taken from simulated molecular interactions on the cell-surface revealed clustering domains (size ～0.2 um) associated with rafts. Sample trajectories of raft constructs exhibited “hop diffusion”. These domains corralled the diffusive motion of membrane proteins. These findings demonstrate that our approach is promising for modelling the localization properties of biological phenomena. | |||||||
| 書誌レコードID | ||||||||
| 収録物識別子タイプ | NCID | |||||||
| 収録物識別子 | AA11464803 | |||||||
| 書誌情報 |
情報処理学会論文誌数理モデル化と応用（TOM） 巻 48, 号 SIG15(TOM18), p. 11-22, 発行日 2007-10-15 |
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| ISSN | ||||||||
| 収録物識別子タイプ | ISSN | |||||||
| 収録物識別子 | 1882-7780 | |||||||
| 出版者 | ||||||||
| 言語 | ja | |||||||
| 出版者 | 情報処理学会 | |||||||
