Item type |
SIG Technical Reports(1) |
公開日 |
2015-09-18 |
タイトル |
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タイトル |
Overlay Cloudで構成する論文再現環境 |
タイトル |
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言語 |
en |
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タイトル |
A Scientific Paper Reproducible Environment with Overlay Cloud Architecture |
言語 |
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言語 |
jpn |
キーワード |
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主題Scheme |
Other |
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主題 |
ネットワーク活用 |
資源タイプ |
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資源タイプ識別子 |
http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh |
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資源タイプ |
technical report |
著者所属 |
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国立情報学研究所 |
著者所属 |
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国立情報学研究所 |
著者所属 |
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国立遺伝学研究所 |
著者所属 |
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ライフサイエンス統合データベースセンター |
著者所属 |
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国立情報学研究所 |
著者所属 |
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国立情報学研究所 |
著者所属(英) |
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en |
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National Institute of Informatics |
著者所属(英) |
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en |
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National Institute of Informatics |
著者所属(英) |
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en |
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National Institute of Genetics |
著者所属(英) |
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en |
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Database Center for Life Science |
著者所属(英) |
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en |
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National Institute of Informatics |
著者所属(英) |
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en |
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National Institute of Informatics |
著者名 |
横山, 重俊
政谷, 好伸
小笠原, 理
大田, 達郎
吉岡, 信和
合田, 憲人
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著者名(英) |
Shigetoshi, Yokoyama
Yoshinobu, Masatani
Osamu, Ogasawara
Tazro, Ohta
Nobukazu, Yoshioka
Kento, Aida
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論文抄録 |
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内容記述タイプ |
Other |
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内容記述 |
バイオインフォマティクス分野などデータセントリックサイエンス分野では,論文発表された実験の再現性確保に対する要請が強く,例えばバイオインフォマティクス分野では DNA 塩基配列の公共データベース構築等によるデータ共有,およびデータ解析ソフトウェアのオープンソース化による処理プログラムの共有が進んでいる.しかし,再現性確保にはプログラム実行に関する次の課題が存在する.1.データ処理ソフトウェアが複雑化・多様化している.2.次世代シーケンサー普及により大量データが分散発生する.3.データ解析量が増大している.本研究では,これらの課題を解決するため,Overlay Cloud アーキテクチャを活用し,インタークラウド上でのバイオインフォマティクスワークフロー再現環境を構築することを目的とする.構築する論文再現環境では,1.データ解析ソフトウェアのコンテナ化によるクラウドを跨る実行可能性確保 (可搬性),2.コンテナ分散配置によるデータとデータ解析プログラム間遅延削減 (分散処理 [データ]),3. 分散処理基盤利用によるデータ解析ソフトウェアの処理性能向上 (分散処理 [コンピュート]),を実現することにより,これらの課題を解決することを目指している.本論文では,特に第一の課題である可搬性確保に取り組んだ結果について報告する. |
論文抄録(英) |
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内容記述タイプ |
Other |
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内容記述 |
The Inter-Cloud is a promising approach for the distributed application demands in some of HPC applications, like Next-Generation-Sequencing Data analytics. However, building the Inter-Cloud environments requires IT expert knowledge. This paper presents an architecture called Overlay Cloud and Virtual Cloud Provider (VCP), which is a middle-ware to automatically build a set of virtual resources on the Inter-Cloud and ease the knowledge requirements. That aims to help to realize ubiquitous scientific paper reproducible environments. |
書誌レコードID |
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収録物識別子タイプ |
NCID |
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収録物識別子 |
AA12628305 |
書誌情報 |
研究報告セキュリティ心理学とトラスト(SPT)
巻 2015-SPT-15,
号 1,
p. 1-8,
発行日 2015-09-18
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ISSN |
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収録物識別子タイプ |
ISSN |
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収録物識別子 |
2188-8671 |
Notice |
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SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc. |
出版者 |
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言語 |
ja |
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出版者 |
情報処理学会 |