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oai:ipsj.ixsq.nii.ac.jp:00210016 2025-01-19T18:18:21Z 1164:2240:10556:10557

ヒト全ゲノム解析プログラム Genomon のスーパーコンピュータ「富岳」向け最適化と性能評価 鈴木, 惣一朗 伊東, 聰 酒井, 憲一郎 稲田, 由江 三吉, 郁夫 石川, 裕 宮野, 悟 HPCアプリケーション 我々はスーパーコンピュータ「富岳」開発プロジェクトのターゲットアプリケーションのひとつとして，ヒト全ゲノム解析プログラム Genomon の「富岳」向け移植と最適化を行ってきた．本稿では，その最適化内容と「富岳」での性能評価について報告する．Genomon の実行性能はディスク I/O 性能に依存するため，特に「富岳」に実装された LLIO（Lightweight Layered IO-Accelerator）ファイルシステムをどのように活用したかを中心に報告する．また，Genomon のスループット性能向上のために試みた複数パイプライン同時実行についても報告する． 情報処理学会 2021-03-08 jpn technical report https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/210016 2188-8841 AN10463942 研究報告ハイパフォーマンスコンピューティング（HPC） 2021-HPC-178 18 1 9 https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/record/210016/files/IPSJ-HPC21178018.pdf application/pdf 2.4 MB 2023-03-08