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アイテム
ノンパラメトリックベイジアンT過程アルゴリズムによる時間的構造変化を考慮した遺伝子発現ネットワーク推定
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/87208
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/87208cc40377a-c625-4bc8-a270-49c08d0dcba4
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
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IPSJ-BIO12032015.pdf (365.8 kB)
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Copyright (c) 2012 by the Information Processing Society of Japan
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| オープンアクセス | ||
| Item type | SIG Technical Reports(1) | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 公開日 | 2012-11-29 | |||||||
| タイトル | ||||||||
| タイトル | ノンパラメトリックベイジアンT過程アルゴリズムによる時間的構造変化を考慮した遺伝子発現ネットワーク推定 | |||||||
| タイトル | ||||||||
| 言語 | en | |||||||
| タイトル | Nonparametric Bayesian T-Process Algorithm for Heterogeneous Gene Regulatory Network | |||||||
| 言語 | ||||||||
| 言語 | jpn | |||||||
| 資源タイプ | ||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh | |||||||
| 資源タイプ | technical report | |||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 早稲田大学先進理工学研究科電気・情報生命専攻 | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 早稲田大学先進理工学研究科電気・情報生命専攻 | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 早稲田大学先進理工学研究科電気・情報生命専攻 | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 早稲田大学先進理工学研究科電気・情報生命専攻 | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 早稲田大学先進理工学研究科電気・情報生命専攻 | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 学習院大学計算機センター | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Waseda University | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Waseda University | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Waseda University | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Waseda University | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Waseda University | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| Gakushuin University | ||||||||
| 著者名 |
宮下, 弘樹
× 宮下, 弘樹
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| 著者名(英) |
Hiroki, Miyashita
× Hiroki, Miyashita
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| 論文抄録 | ||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||
| 内容記述 | 本稿では，ノンパラメトリック・ベイズ的枠組みの一つであるT過程を回帰モデルに用いることにより，時間的に構造が変化するダイナミックベイジアンネットワークを推定することを目的とする．特に，実データとして Drosophila melanogaster の遺伝子発現データを用い，生命現象に内在すると考えられる非線形性の依存関係および各成長段階をおける依存関係の変化を考慮した上での遺伝子発現ネットワーク推定を主題とする．全体の推定アルゴリズムを構築するにあたり，リバーシブルジャンプマルコフ連鎖モンテカルロ法 (RJMCMC) の枠組みによる実装を採用している． | |||||||
| 論文抄録(英) | ||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||
| 内容記述 | A nonparametric Bayesian model is employed to estimate gene regulatory networks of Drosophila melanogaster. A T-process-based algorithm is expected to capture nonlinear dynamics in the life phenomenon and reconstruct the gene regulatory interactions with consideration of the actual timing of morphogenic transitions. The whole algorithm is implemented by a reversible jump Markov Chain Monte Carlo. | |||||||
| 書誌レコードID | ||||||||
| 収録物識別子タイプ | NCID | |||||||
| 収録物識別子 | AA12055912 | |||||||
| 書誌情報 |
研究報告バイオ情報学（BIO） 巻 2012-BIO-32, 号 15, p. 1-6, 発行日 2012-11-29 |
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| Notice | ||||||||
| SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc. | ||||||||
| 出版者 | ||||||||
| 言語 | ja | |||||||
| 出版者 | 情報処理学会 | |||||||
