時系列発現プロファイルのための遺伝子機能グループ解析手法

• Item type: SIG Technical Reports(1)
• 公開日: 2012-06-21
• タイトル: 時系列発現プロファイルのための遺伝子機能グループ解析手法
• タイトル / 言語: en
• タイトル: Gene Set Enrichment Analysis for Time-series Gene Expression Profiles
• 言語: jpn
• 資源タイプ / 資源タイプ識別子: http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh
• 資源タイプ: technical report
• 著者所属: 大阪大学大学院情報科学研究科
• 著者所属: 大阪大学大学院情報科学研究科
• 著者所属: 大阪大学大学院情報科学研究科
• 著者所属: 大阪大学大学院情報科学研究科
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Osaka University Graduate Scool of information Science and Technology
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Osaka University Graduate Scool of information Science and Technology
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Osaka University Graduate Scool of information Science and Technology
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Osaka University Graduate Scool of information Science and Technology
• 著者名: 大熊, 祐太; 瀬尾, 茂人; 竹中, 要一; 松田, 秀雄
• 著者名(英): Yuta, Okuma; Shigeto, Seno; Yoichi, Takenaka; Hideo, Matsuda
• 論文抄録 / 内容記述タイプ: Other
• 論文抄録 / 内容記述: 遺伝子の機能は研究され, 遺伝子に付加される機能情報は日々増加し続けている．こうした遺伝子機能情報を利用した解析手法の一つに, 2つの実験条件の比較を目的とした遺伝子機能グループ解析がある．しかし, この解析手法では遺伝子機能の時間変化を解析することができない．そこで本研究では, 時系列データをスライディングウィンドウ方式で分割し, すべての分割期間に対して遺伝子機能グループ解析手法を実行することで時系列に対応できる遺伝子機能グループ解析を提案する．その結果, ある遺伝子機能が特定の期間で有意に発現していることを示した．
• 論文抄録(英) / 内容記述タイプ: Other
• 論文抄録(英) / 内容記述: Gene function is researched and gene functional information which is annotated on gene is increasing continuously. Gene Set Analysis is one of a method using gene functional information, and we use it when we want to compare two groups. However, this method can not be applied to time-series gene expression profile. In this reserch, I propose a method to analyze gene function groupsand handle time-series data. The method extracts a time period in which works from a time-series gene expression profile.
• 書誌レコードID / 収録物識別子タイプ: NCID
• 書誌レコードID / 収録物識別子: AA12055912
• 書誌情報: 研究報告バイオ情報学（BIO）; 巻 2012-BIO-29, 号 26, p. 1-7, 発行日 2012-06-21
• Notice: SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc.
• 出版者 / 言語: ja
• 出版者: 情報処理学会