WEKO3
アイテム
RNA干渉の被食者捕食者モデルによる動態解析
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/81534
https://ipsj.ixsq.nii.ac.jp/records/815348bd323a9-2222-4f69-a6e6-a53939828888
| 名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
|---|---|---|
IPSJ-BIO12028004.pdf (307.0 kB)
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Copyright (c) 2012 by the Information Processing Society of Japan
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| オープンアクセス | ||
| Item type | SIG Technical Reports(1) | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 公開日 | 2012-03-21 | |||||||
| タイトル | ||||||||
| タイトル | RNA干渉の被食者捕食者モデルによる動態解析 | |||||||
| タイトル | ||||||||
| 言語 | en | |||||||
| タイトル | Prey-Predator model for dynamics of RNA interference | |||||||
| 言語 | ||||||||
| 言語 | jpn | |||||||
| 資源タイプ | ||||||||
| 資源タイプ識別子 | http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh | |||||||
| 資源タイプ | technical report | |||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 株式会社サイトパスファインダー | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 株式会社サイトパスファインダー | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 株式会社サイトパスファインダー | ||||||||
| 著者所属 | ||||||||
| 独立行政法人産業技術総合研究所 | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| CytoPathFinder, inc | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| CytoPathFinder, inc | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| CytoPathFinder, inc | ||||||||
| 著者所属(英) | ||||||||
| en | ||||||||
| National Institute of Advanced Industrial Science and Technology | ||||||||
| 著者名 |
上田, 尚学
× 上田, 尚学
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| 著者名(英) |
Takanori, Ueda
× Takanori, Ueda
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| 論文抄録 | ||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||
| 内容記述 | RNA干渉(RNAi)の動態を表現する数理モデルとして、分子機構に基づいた微分方程式系がいくつか提案されている。これらはRNAiに関わる各要素について立式しているためパラメータ数が多く、また実際の観測が不可能である変数を複数含んでおり、モデルを同定するためのデータの取得は容易ではない。我々はRNAiの作用が被食者/捕食者系として捉えられることに着目し、ロトカ・ヴォルテラ型の競争モデルが十分にRNAiの動態を表現できることを、HeLa細胞のアポトーシス系の観測のモデリングにより確認した。これにより、直接には観測できないsiRNAの効果の強さを表すことができる。 | |||||||
| 論文抄録(英) | ||||||||
| 内容記述タイプ | Other | |||||||
| 内容記述 | Several Oridinary Differential Equation (ODE) models have been proposed to represent RNA Interference (RNAi) dynamics to today. These consist of equations for all each element involved in RNAi, so they have many parameters. They also have ‘hidden variables’ which can not be observed by experiments. These facts make identification of model parameters difficult. RNAi phenomenon can be considered as ‘Prey/Predator’ system. We applied the modified conpetitive Lotka-Volterra model to dynamics of apoptosis of HeLa cells by siRNA transfection. We show the model represents the dynamics of the phenomenon and also represents hidden dynamics of siRNA effect. | |||||||
| 書誌レコードID | ||||||||
| 収録物識別子タイプ | NCID | |||||||
| 収録物識別子 | AA12055912 | |||||||
| 書誌情報 |
研究報告バイオ情報学（BIO） 巻 2012-BIO-28, 号 4, p. 1-6, 発行日 2012-03-21 |
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| Notice | ||||||||
| SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc. | ||||||||
| 出版者 | ||||||||
| 言語 | ja | |||||||
| 出版者 | 情報処理学会 | |||||||
