サポートベクターマシンを用いた血友病Bデータベースの解析－アミノ酸置換の第IX因子活性への影響－

• Item type: SIG Technical Reports(1)
• 公開日: 2011-09-08
• タイトル: サポートベクターマシンを用いた血友病Bデータベースの解析－アミノ酸置換の第IX因子活性への影響－
• タイトル / 言語: en
• タイトル: Analysis of the database in hemophilia B by Support Vector Machine -Influence of Amino-acid substitution on factor IX-
• 言語: jpn
• 資源タイプ / 資源タイプ識別子: http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh
• 資源タイプ: technical report
• 著者所属: 宮崎大学情報基盤センター
• 著者所属: 宮崎大学大学院工学研究科
• 著者所属: 宮崎大学大学院工学研究科
• 著者所属: 宮崎大学大学院工学研究科
• 著者所属: 宮崎大学大学院工学研究科
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Information Technology Center, University of Miyazaki
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Graduate School of Engineering, University of Miyazaki
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Graduate School of Engineering, University of Miyazaki
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Graduate School of Engineering, University of Miyazaki
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Graduate School of Engineering, University of Miyazaki
• 著者名: 青木, 謙二; 末吉, 健二; 石橋, 太郎; 坂本, 眞人; 古谷, 博史
• 著者名(英): Kenji, Aoki; Kenji, Sueyoshi; Taro, Ishibashi; Makoto, Sakamoto; Hiroshi, Furutani
• 論文抄録 / 内容記述タイプ: Other
• 論文抄録 / 内容記述: 血友病 B は血液凝固因子の一つである第 IX 因子の異常によって引き起こされる遺伝性疾患である．血友病 B については，患者の遺伝子異常がデータベース化され，血友病 B を分子レベルで組織的に研究することが可能である．本論文は，第 IX 因子のアミノ酸ミスセンス変異において，アミノ酸置換に伴う物理化学的パラメータ （分子体積，疎水性，極性，等電点，残基間接触エネルギー） の変化量を用いてサポートベクターマシンにより第 IX 因子の活性度を予測し，重症度を推定するものである．この結果，ロジスティック回帰分析による推定結果よりも優れた結果が得られた．また，パラメータとして過去の研究で用いられていなかったアミノ酸の残基間接触エネルギーを加えることにより，よりよい推定結果が得られることが分かった．
• 論文抄録(英) / 内容記述タイプ: Other
• 論文抄録(英) / 内容記述: Hemophilia B is caused by decreased activity of factor IX. Mutation in factor IX is made up of a majority of amino acid substitutions. Hemophilia B is possible for a patient's gene abnormality to be put in a database and is studied systematically with a molecular level. In this paper, in the amino acid missense mutation of factor IX, we predict the activity of factor IX by Support Vector Machine (SVM) using the amount of change of the physicochemical parameters accompanying amino acid substitution, and presume severity of illness. As a result, the SVM was superior to Logistic Regression Analysis. Moreover, the better presumed result was obtained by adding the interresidue contact energy.
• 書誌レコードID / 収録物識別子タイプ: NCID
• 書誌レコードID / 収録物識別子: AN10505667
• 書誌情報: 研究報告数理モデル化と問題解決（MPS）; 巻 2011-MPS-85, 号 7, p. 1-8, 発行日 2011-09-08
• Notice: SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc.
• 出版者 / 言語: ja
• 出版者: 情報処理学会