水の情報エントロピーに注目したタンパク質のリガンド結合部位予測法の開発

• Item type: SIG Technical Reports(1)
• 公開日: 2011-06-16
• タイトル: 水の情報エントロピーに注目したタンパク質のリガンド結合部位予測法の開発
• タイトル / 言語: en
• タイトル: Development of protein ligand binding site prediction focused on water information entropy
• 言語: jpn
• キーワード / 主題Scheme: Other
• キーワード / 主題: バイオ情報学研究会・一般講演（A）
• 資源タイプ / 資源タイプ識別子: http://purl.org/coar/resource_type/c_18gh
• 資源タイプ: technical report
• 著者所属: 東京工業大学計算工学専攻
• 著者所属: 東京工業大学計算工学専攻／東京工業大学学術国際情報センター
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Department of Computer Science, Tokyo Institute of Technology
• 著者所属(英): en
• 著者所属(英): Department of Computer Science, Tokyo Institute of Technology / Global Scientific Information and Computing Center, Tokyo Institute of Technology
• 著者名: 佐々木, 孝章; 関嶋, 政和
• 著者名(英): Takaaki, Sasaki; Masakazu, Sekijima
• 論文抄録 / 内容記述タイプ: Other
• 論文抄録 / 内容記述: タンパク質とリガンドの結合は，タンパク質の機能発現や創薬に重要である．タンパク 3000 プロジェクトを始めとするタンパク質の大規模な構造解析により，多くのタンパク質の構造情報が得られてきており，タンパク質とリガンドとの結合を予測し，機能発現や創薬への応用が期待されている．従来，リガンド結合部位は立体構造解析と静電場の解析から求められてきており，その結果，in silico による創薬では相補的構造を有する分子を中心に探索されている．本研究では，水分子が自由度を得るとエントロピー的に有利に機能することを利用し，タンパク質周囲の水分子の情報エントロピーに注目し，リガンドの結合部位予測を行うシステムを開発した．
• 論文抄録(英) / 内容記述タイプ: Other
• 論文抄録(英) / 内容記述: Protein and ligand docking is important for expression of protein function and drug development. Protein 3000 project and other structural analysis project determined much protein structures. And this huge structural information is expected to contribute analysis of expression of protein function and drug development. Previously, ligand binding pocket analysis was based on shape complementarity and electrostatic interaction. We developed and evaluated protein ligand binding site prediction system focused on information entropy of water around protein.
• 書誌レコードID / 収録物識別子タイプ: NCID
• 書誌レコードID / 収録物識別子: AA12055912
• 書誌情報: 研究報告 バイオ情報学（BIO）; 巻 2011-BIO-25, 号 29, p. 1-5, 発行日 2011-06-16
• Notice: SIG Technical Reports are nonrefereed and hence may later appear in any journals, conferences, symposia, etc.
• 出版者 / 言語: ja
• 出版者: 情報処理学会